More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003964 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  91.95 
 
 		 261 aa  467  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  81.47 
 
 		 259 aa  411  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  77.43 
 
 		 256 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  59.29 
 
 		 259 aa  316  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  57.42 
 
 		 257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  54.69 
 
 		 257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  53.54 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  53.15 
 
 		 259 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  53.15 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  53.15 
 
 		 259 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1512  hypothetical protein  53.1 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  53.75 
 
 		 281 aa  275  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  51.95 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3087  hypothetical protein  54.09 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2726  protein of unknown function DUF81  51.97 
 
 		 257 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90408  hitchhiker  0.000647334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1617  hypothetical protein  51.97 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.449373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1651  hypothetical protein  51.97 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1628  hypothetical protein  52.14 
 
 		 257 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  52.12 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  50.39 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  51.74 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  51.74 
 
 		 257 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  53.28 
 
 		 257 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  50 
 
 		 280 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  53.1 
 
 		 256 aa  265  8e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  50 
 
 		 259 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  50.78 
 
 		 259 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2631  hypothetical protein  50.2 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1248  hypothetical protein  51.92 
 
 		 257 aa  242  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18220  hypothetical protein  48.63 
 
 		 289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891224  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  39.36 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  42.02 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  40.39 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  39.59 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  39.62 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  39.18 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  38.46 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  38.4 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  39.52 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  39.75 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  38.82 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  37.3 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  40.57 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  40.33 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  40.33 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  40.59 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  40.33 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  40.33 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  37.34 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  38.34 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  39.04 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  39.04 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  39.04 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  38.34 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  39.92 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  38.76 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  40.17 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  40.17 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  36.86 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  35.97 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  35.97 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  38.27 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  38.43 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  38.82 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  35.97 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  38.82 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  38.56 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  39.76 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  38.34 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  34.96 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  38.82 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  37.96 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  37.01 
 
 		 250 aa  150  3e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  34.78 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  39.38 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  36.43 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  36.43 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  35.41 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  36.33 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  36.36 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  37.4 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  37.94 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  37.6 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  38.28 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  38.49 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  34.78 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  34.78 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  34.78 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  34.39 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  34.87 
 
 		 255 aa  143  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  33.59 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  33.2 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  33.2 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  33.2 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  33.2 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  37.7 
 
 		 253 aa  141  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  34.63 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  38.15 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>