294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0368 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  495  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  84.06 
 
 
251 aa  422  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  83.67 
 
 
251 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  51.82 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  51.82 
 
 
256 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  51.82 
 
 
256 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  50.61 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  51.42 
 
 
256 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  51.42 
 
 
259 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  51.42 
 
 
256 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  50.4 
 
 
269 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  50.4 
 
 
269 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  51.01 
 
 
256 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  52.05 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  51.82 
 
 
259 aa  232  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  49.8 
 
 
259 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  48.79 
 
 
260 aa  225  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  45.9 
 
 
257 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  47.98 
 
 
268 aa  222  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  47.98 
 
 
268 aa  222  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  50.2 
 
 
253 aa  222  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  47.98 
 
 
268 aa  222  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  48.4 
 
 
267 aa  221  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  51.6 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  46.25 
 
 
266 aa  214  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  45.2 
 
 
270 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  43.85 
 
 
259 aa  205  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  44.12 
 
 
267 aa  205  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  43.2 
 
 
269 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  43.2 
 
 
269 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  43.2 
 
 
269 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  43.2 
 
 
269 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  43.2 
 
 
269 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  46.12 
 
 
261 aa  198  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  40.91 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  45.45 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0265  hypothetical protein  47.01 
 
 
252 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  45.04 
 
 
266 aa  193  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  39.27 
 
 
261 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  44.05 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  44.05 
 
 
272 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  40.89 
 
 
253 aa  188  9e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  38.96 
 
 
253 aa  187  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5469  hypothetical protein  46.06 
 
 
264 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51215  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  46.55 
 
 
269 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  46.12 
 
 
269 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  46.12 
 
 
269 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  46.12 
 
 
269 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  46.12 
 
 
269 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  46.12 
 
 
269 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  46.12 
 
 
269 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  46.12 
 
 
269 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  46.12 
 
 
269 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  42.4 
 
 
259 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  42.59 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  42 
 
 
259 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  43.1 
 
 
272 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  43.53 
 
 
261 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  41.2 
 
 
259 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  38.98 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  38.71 
 
 
259 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  41.67 
 
 
223 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  39.27 
 
 
257 aa  177  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  39.83 
 
 
257 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  38.25 
 
 
270 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  40.24 
 
 
253 aa  175  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  42.29 
 
 
254 aa  174  9e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  41.1 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  38.67 
 
 
281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  38.58 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00918  hypothetical protein  43.85 
 
 
259 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  38.31 
 
 
259 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  39.09 
 
 
249 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  39.75 
 
 
256 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  38.66 
 
 
250 aa  167  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  40.25 
 
 
254 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  38.58 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  39.64 
 
 
263 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  38.11 
 
 
259 aa  165  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  42.31 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  43.16 
 
 
253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  38.1 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  37.4 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  40.16 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2446  hypothetical protein  39.57 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.335155  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  39.92 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  36.99 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  37.87 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  42.02 
 
 
261 aa  162  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  39 
 
 
254 aa  161  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  40.16 
 
 
263 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  39 
 
 
254 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  39 
 
 
254 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  40.33 
 
 
261 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  36.4 
 
 
257 aa  158  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  36.84 
 
 
252 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1961  hypothetical protein  44.26 
 
 
261 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  35.98 
 
 
257 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  35.56 
 
 
257 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  35.97 
 
 
263 aa  155  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>