More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2248 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  504  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  40.48 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  40.64 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  44.87 
 
 		 269 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  44.87 
 
 		 269 aa  201  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  44.83 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  42.28 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  42.28 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  41.87 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  41.34 
 
 		 267 aa  195  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  38.8 
 
 		 257 aa  194  8.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  41.74 
 
 		 257 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  42.44 
 
 		 253 aa  194  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  42.74 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  41.83 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  41.83 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  41.06 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  41.83 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  44.83 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  42.4 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  43.51 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  42.02 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  42.19 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  41.18 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  41.13 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  41.8 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  38.89 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  42.62 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  38.91 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  40.17 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  38.1 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  38.1 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  38.1 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  38.1 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  39.33 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  41.06 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  38.1 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  41.81 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  41.15 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  39.75 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  40.17 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  40.6 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  41.15 
 
 		 259 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  40.87 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  39.92 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  39.53 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  41.25 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  40.33 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  39.67 
 
 		 260 aa  175  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  43.23 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  39.29 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  38.89 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  38.89 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  38.89 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  38.89 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  38.89 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  38.89 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  38.89 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  38.89 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  37.8 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  39.52 
 
 		 261 aa  171  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  39.52 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  40.24 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  43.16 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  39.84 
 
 		 259 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  39.23 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  40.34 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  39.85 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  39.62 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2726  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90408  hitchhiker  0.000647334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1651  hypothetical protein  40.08 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  39.46 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1617  hypothetical protein  40.08 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.449373  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  42.74 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  41.96 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  39.11 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  39.46 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1628  hypothetical protein  38.82 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  36.43 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  39.75 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  39.68 
 
 		 266 aa  164  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  39.68 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  40.55 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  37.74 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  38.61 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  38.46 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2446  hypothetical protein  40.08 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.335155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  40.98 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  43.59 
 
 		 263 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  37.45 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  41.52 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2502  hypothetical protein  41.74 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18220  hypothetical protein  43.39 
 
 		 289 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891224  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1512  hypothetical protein  37.07 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  36.19 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  36.19 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1248  hypothetical protein  36.82 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112038 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  35.8 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  41.63 
 
 		 249 aa  158  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  38.56 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>