More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2613 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  99.22 
 
 		 256 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  94.14 
 
 		 256 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  93.75 
 
 		 256 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  94.14 
 
 		 256 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  94.14 
 
 		 256 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  93.75 
 
 		 256 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  92.97 
 
 		 257 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  85.6 
 
 		 267 aa  423  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  80.08 
 
 		 253 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  79.3 
 
 		 268 aa  401  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  79.3 
 
 		 259 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  78.12 
 
 		 259 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  78.82 
 
 		 259 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  77.17 
 
 		 260 aa  394  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  78.66 
 
 		 254 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  59.92 
 
 		 257 aa  295  7e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  56.57 
 
 		 268 aa  285  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  56.57 
 
 		 268 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  56.57 
 
 		 268 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  57.09 
 
 		 267 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  55.28 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  56.38 
 
 		 270 aa  272  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  57.02 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  57.02 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  57.02 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  57.02 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  57.02 
 
 		 269 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  55.69 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  58.68 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  58.68 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  58.68 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  58.68 
 
 		 269 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  58.68 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  58.68 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  58.68 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  58.68 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  58.68 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  57.72 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  57.72 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  51.39 
 
 		 259 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  50.4 
 
 		 254 aa  238  8e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  50.2 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  49.8 
 
 		 251 aa  234  8e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  51.19 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1961  hypothetical protein  54.98 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00918  hypothetical protein  54.18 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  47.56 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  47.27 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  48.72 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  43.87 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  44.88 
 
 		 253 aa  211  7e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  43.05 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  42.6 
 
 		 223 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  46.77 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2446  hypothetical protein  46.67 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.335155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  43.08 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  45.45 
 
 		 254 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  45.38 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  45.45 
 
 		 272 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  45.38 
 
 		 272 aa  198  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  44.05 
 
 		 263 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  42.47 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  46.69 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  43.87 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2502  hypothetical protein  46.02 
 
 		 252 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  44.09 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  46.25 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  41.3 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4374  hypothetical protein  45.9 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.716093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  44 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  44.87 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  43.25 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  41.18 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  45.08 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0265  hypothetical protein  47.24 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  40.08 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5469  hypothetical protein  44.17 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  40.62 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  38.43 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  37.25 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  37.25 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  38.04 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  38.13 
 
 		 280 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  38.34 
 
 		 250 aa  160  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  40.89 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  35.63 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  36.86 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0966  hypothetical protein  42.62 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0162432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  37.19 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  38.28 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0542  hypothetical protein  39.84 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  36.86 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  36.82 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  40.68 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0842  hypothetical protein  43.42 
 
 		 262 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.213592 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  36.61 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  39.75 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>