More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2471 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  503  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  99.22 
 
 		 257 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  98.83 
 
 		 257 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  94.55 
 
 		 257 aa  487  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1512  hypothetical protein  89.11 
 
 		 257 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1651  hypothetical protein  87.89 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1617  hypothetical protein  87.89 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.449373  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2726  protein of unknown function DUF81  87.5 
 
 		 257 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90408  hitchhiker  0.000647334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1628  hypothetical protein  87.5 
 
 		 257 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  69.14 
 
 		 257 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  68.75 
 
 		 257 aa  345  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  70.04 
 
 		 257 aa  345  5e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  66.41 
 
 		 256 aa  340  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3087  hypothetical protein  69.92 
 
 		 256 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2631  hypothetical protein  64.84 
 
 		 257 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1248  hypothetical protein  61.48 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  53.88 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  54.33 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  54.15 
 
 		 259 aa  255  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  50 
 
 		 259 aa  249  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  52.73 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  51.74 
 
 		 261 aa  248  9e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  49.61 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  49.22 
 
 		 259 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  48.44 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  48.05 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  48.83 
 
 		 280 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  49.61 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  50 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  50 
 
 		 259 aa  234  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18220  hypothetical protein  47.29 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891224  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  38.31 
 
 		 253 aa  178  9e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  35.08 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  37.87 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  36.18 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  40.41 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  39.46 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  35.56 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  39.29 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  38.91 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  35.92 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  36.9 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  38.08 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  35.51 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  40.24 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  36.72 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  36.72 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  36.72 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  36.33 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  37.25 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  36.72 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  36.72 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  35.2 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  35.22 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  40 
 
 		 261 aa  148  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  36.72 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  40 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  37.45 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  37.45 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  37.45 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  36.33 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  36.33 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  35.55 
 
 		 267 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  34.8 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  34.8 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  34.8 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  35.53 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  38.66 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  39.5 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  36.96 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  36.11 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  34.73 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  35.16 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  38.19 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  39.18 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  36.73 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  34.13 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  34.65 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  33.85 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  35.15 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  34.82 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  35.68 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  35.17 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  34.65 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  34.65 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  33.07 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  34.25 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  37.4 
 
 		 266 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  34.25 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  37.25 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  34.02 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  35.27 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  35.27 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  35.27 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  35.27 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  37.39 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  34.75 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  34.65 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  35.27 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  37.29 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>