More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1748 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  68.2 
 
 		 261 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  67.82 
 
 		 261 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  63.98 
 
 		 261 aa  335  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  63.98 
 
 		 272 aa  335  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  66.8 
 
 		 272 aa  334  9e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  51.2 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  47.47 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2502  hypothetical protein  54.87 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  51.29 
 
 		 263 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  51.19 
 
 		 269 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  51.19 
 
 		 269 aa  236  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  51.98 
 
 		 256 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  50.64 
 
 		 263 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  49.38 
 
 		 268 aa  235  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  49.38 
 
 		 268 aa  235  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  49.38 
 
 		 268 aa  235  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  50.79 
 
 		 256 aa  235  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  51.64 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  48.82 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  49.03 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  51.19 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  50.79 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  50.79 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  50.79 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  50.79 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  46.48 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  48.63 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  48.63 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  48.63 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  48.63 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  48.63 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  49.19 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  47.06 
 
 		 267 aa  225  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  47.49 
 
 		 270 aa  225  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4374  hypothetical protein  50.58 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.716093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  49.8 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  47.47 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  50 
 
 		 266 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  47.56 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  46.48 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  48.59 
 
 		 253 aa  214  8e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  49.22 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  44.8 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  45.35 
 
 		 266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  47.49 
 
 		 269 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  47.49 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  47.49 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  47.49 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  47.49 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  47.49 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  47.49 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  47.49 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  47.49 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  46.12 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  47.5 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0542  hypothetical protein  47.33 
 
 		 263 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  45.16 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  44.35 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  43.85 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  43.44 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  50 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  43.78 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  45.19 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  43.51 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  44.54 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  41.94 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  44.92 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  41.01 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  42.62 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2446  hypothetical protein  42.68 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.335155  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00918  hypothetical protein  44.05 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  37.3 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  39.02 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  36.15 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  36.54 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  43.51 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  36.15 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  36.15 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  38.62 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  36.78 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  36.15 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  36.15 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  36.15 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1961  hypothetical protein  45.06 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  36.92 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  39.83 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  40.49 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  36.21 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  35 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  41.18 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  37.96 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  35 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  40.5 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  41.37 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  40.5 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  41.6 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  40.34 
 
 		 286 aa  158  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  41.7 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  40.5 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>