More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2484 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  74.61 
 
 		 257 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  72.27 
 
 		 257 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3087  hypothetical protein  71.88 
 
 		 256 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2726  protein of unknown function DUF81  69.14 
 
 		 257 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90408  hitchhiker  0.000647334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1651  hypothetical protein  68.75 
 
 		 257 aa  354  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1617  hypothetical protein  68.75 
 
 		 257 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.449373  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1512  hypothetical protein  70.7 
 
 		 257 aa  353  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1628  hypothetical protein  68.75 
 
 		 257 aa  353  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  69.14 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  68.75 
 
 		 257 aa  345  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  68.36 
 
 		 257 aa  343  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  66.41 
 
 		 257 aa  339  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  62.89 
 
 		 256 aa  327  8e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1248  hypothetical protein  61.72 
 
 		 257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112038 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2631  hypothetical protein  60.08 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  54.12 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  53.94 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  53.52 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  51.95 
 
 		 261 aa  254  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  50.58 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  53.97 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  50.39 
 
 		 281 aa  251  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  48.64 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  49.03 
 
 		 280 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  49.22 
 
 		 259 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  49.22 
 
 		 259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  49.03 
 
 		 259 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  48.64 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  49.02 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18220  hypothetical protein  47.06 
 
 		 289 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891224  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  36.4 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  38.14 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  41.3 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  38.43 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  39.91 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  37.35 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  34.13 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  40.5 
 
 		 251 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  36.73 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  37.14 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  38.3 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  36.72 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  37.11 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  38.56 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  37.45 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  39.13 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  38.17 
 
 		 261 aa  148  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  38.17 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  36.51 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  36.14 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  35.91 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  35.71 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  36.11 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  36.25 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  37.96 
 
 		 267 aa  145  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  35.74 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  35.32 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  35.32 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  36.14 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  36.97 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  36.1 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  36.99 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  36.51 
 
 		 255 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  37.34 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  37.34 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  36.93 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  37.34 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  36.11 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  35.32 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  36.59 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  33.19 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  35.32 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  37.61 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  34.41 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  34.66 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  38.37 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  35.89 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  38.37 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  36.48 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  34.26 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  34.26 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  34.78 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  37.07 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  34 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  34.69 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  34.75 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  35 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  36.1 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  34.14 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  34.2 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  34.32 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  36.1 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  34.32 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  34.32 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  34.32 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  34.32 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  35.29 
 
 		 260 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  35.68 
 
 		 268 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>