296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2072 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  551  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  78.21 
 
 		 259 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  75.49 
 
 		 259 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  72.66 
 
 		 280 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  74.71 
 
 		 259 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  72.59 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  75.1 
 
 		 259 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  78.38 
 
 		 259 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  72.76 
 
 		 259 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18220  hypothetical protein  70.74 
 
 		 289 aa  349  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891224  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  52.12 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  47.86 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  53.31 
 
 		 256 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  53.36 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  53.75 
 
 		 261 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  50.98 
 
 		 256 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  50.39 
 
 		 257 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  53.17 
 
 		 259 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  50.39 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1651  hypothetical protein  50.58 
 
 		 257 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2726  protein of unknown function DUF81  50.58 
 
 		 257 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90408  hitchhiker  0.000647334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1617  hypothetical protein  50.58 
 
 		 257 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.449373  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1512  hypothetical protein  51.17 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1628  hypothetical protein  50.58 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  50.39 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  50 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  50.77 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3087  hypothetical protein  50 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  49.61 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1248  hypothetical protein  52.14 
 
 		 257 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112038 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2631  hypothetical protein  48.45 
 
 		 257 aa  229  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  41.25 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  38.67 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  40.86 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  41.9 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  40.86 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  37.55 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  39.76 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  40.47 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  39.16 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  36.65 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  37.05 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  40.08 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  40.08 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  39.68 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  39.68 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  39.68 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  40.08 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  39.53 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  38.89 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  41.11 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  39.69 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  38.19 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  42.19 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  39.92 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  40.65 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  37.55 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  37.64 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  37.64 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  37.64 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  37.64 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  37.64 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  38.89 
 
 		 266 aa  159  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  36.68 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  40.55 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  37.94 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  38.13 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  37.8 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  36.86 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  40.71 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  37.25 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  40.08 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  35.97 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  35.97 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  36.59 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  40.32 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  36.36 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  40.39 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  37.7 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  38.89 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  36.58 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  36.68 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  36.68 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  36.68 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  36.68 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  36.68 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  36.68 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  36.68 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  36.68 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  39.42 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  36.68 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  34.31 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  38.7 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  36.19 
 
 		 255 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  36.19 
 
 		 255 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  36.19 
 
 		 255 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  39.52 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  34 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  36.19 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>