299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40940 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  95.37 
 
 
259 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  77.22 
 
 
259 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  77.22 
 
 
259 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  77.22 
 
 
259 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  77.99 
 
 
259 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  77.43 
 
 
259 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  78.99 
 
 
281 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  76.45 
 
 
280 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18220  hypothetical protein  73.23 
 
 
289 aa  348  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891224  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  48.64 
 
 
259 aa  263  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  52.96 
 
 
256 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  51.17 
 
 
261 aa  260  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  50.58 
 
 
257 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  50.78 
 
 
261 aa  255  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  49.61 
 
 
257 aa  251  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  51.37 
 
 
259 aa  251  9.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2726  protein of unknown function DUF81  48.83 
 
 
257 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90408  hitchhiker  0.000647334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1651  hypothetical protein  48.83 
 
 
257 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  49.02 
 
 
257 aa  248  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1617  hypothetical protein  48.83 
 
 
257 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.449373  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  51.75 
 
 
256 aa  248  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1628  hypothetical protein  48.83 
 
 
257 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  50 
 
 
257 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1512  hypothetical protein  49.61 
 
 
257 aa  247  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  50 
 
 
257 aa  246  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  49.61 
 
 
257 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  49.61 
 
 
257 aa  246  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1248  hypothetical protein  52.53 
 
 
257 aa  245  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3087  hypothetical protein  48.64 
 
 
256 aa  235  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2631  hypothetical protein  50.58 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  41.5 
 
 
253 aa  190  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  38.55 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  38.96 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  41.8 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  38.74 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  40.85 
 
 
254 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  38.58 
 
 
254 aa  175  8e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  40.24 
 
 
259 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  37.21 
 
 
254 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  37.21 
 
 
254 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  38.4 
 
 
251 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  38.43 
 
 
257 aa  169  5e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  36.82 
 
 
254 aa  168  9e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  41.77 
 
 
267 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  39.29 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  39.61 
 
 
256 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  41.27 
 
 
254 aa  165  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  37.79 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  42.32 
 
 
254 aa  165  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  39.22 
 
 
256 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  39.22 
 
 
256 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  39.69 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  38.82 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  37.6 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  40.98 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  38.43 
 
 
256 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  35.98 
 
 
255 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  38.04 
 
 
269 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  38.04 
 
 
269 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  43.46 
 
 
253 aa  158  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  40.39 
 
 
266 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  38.82 
 
 
256 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  40.41 
 
 
253 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  37.31 
 
 
269 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  37.31 
 
 
269 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  36.61 
 
 
253 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  37.31 
 
 
269 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  37.31 
 
 
269 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  37.31 
 
 
269 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  36.47 
 
 
268 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  36.47 
 
 
268 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  37.04 
 
 
267 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  36.47 
 
 
268 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  37.1 
 
 
266 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  36.54 
 
 
270 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  37.02 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  37.7 
 
 
259 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  37.15 
 
 
255 aa  151  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  39.22 
 
 
266 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  36.98 
 
 
260 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  40.43 
 
 
261 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  36.36 
 
 
255 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  36.36 
 
 
255 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  36.36 
 
 
255 aa  148  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  37.8 
 
 
268 aa  148  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  39.39 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  36.36 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  36.76 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  36.96 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  36.75 
 
 
261 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  37.6 
 
 
272 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  37.65 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  38.55 
 
 
261 aa  145  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  38.52 
 
 
272 aa  145  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  36.92 
 
 
269 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  37.77 
 
 
254 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  36.92 
 
 
269 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  36.92 
 
 
269 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  36.92 
 
 
269 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>