More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2571 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  99.63 
 
 		 269 aa  533  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  90.71 
 
 		 270 aa  492  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  90.71 
 
 		 269 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  90.71 
 
 		 269 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  90.33 
 
 		 269 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  90.71 
 
 		 269 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  90.71 
 
 		 269 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  90.71 
 
 		 269 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  90.71 
 
 		 269 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  90.71 
 
 		 269 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  90.71 
 
 		 269 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  73.48 
 
 		 266 aa  397  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  72.35 
 
 		 268 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  72.35 
 
 		 268 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  72.35 
 
 		 268 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  71.37 
 
 		 266 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  70.99 
 
 		 266 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  66.03 
 
 		 267 aa  355  5.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  64.12 
 
 		 266 aa  352  4e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  58.1 
 
 		 259 aa  285  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  57.81 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  55.16 
 
 		 257 aa  282  5.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  55.6 
 
 		 259 aa  275  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  55.56 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  53.38 
 
 		 267 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  57.02 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  57.02 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  57.85 
 
 		 256 aa  270  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  56.61 
 
 		 256 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  56.2 
 
 		 256 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  55.97 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  55.37 
 
 		 256 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  57.44 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  54.96 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  54.96 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  51 
 
 		 259 aa  258  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  52.38 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  54.51 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  49.77 
 
 		 223 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  48.07 
 
 		 256 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  49.32 
 
 		 223 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  48.16 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  49.79 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00918  hypothetical protein  52 
 
 		 259 aa  221  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  48.56 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  43.66 
 
 		 272 aa  218  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  43.66 
 
 		 261 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  45.9 
 
 		 272 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  42.52 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  46.86 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  46.03 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  43.82 
 
 		 257 aa  204  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  42.91 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  43.2 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  43.21 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  43.03 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  46.86 
 
 		 263 aa  195  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1961  hypothetical protein  48.41 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  44.69 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2502  hypothetical protein  43.86 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  40.8 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  44.25 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  40.71 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  40.87 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  40.69 
 
 		 254 aa  184  9e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  40.16 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4374  hypothetical protein  45.27 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.716093 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  38.96 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  42.42 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  40.25 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  40.25 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  40.25 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  44.26 
 
 		 253 aa  171  7.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  40.25 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2446  hypothetical protein  40.16 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.335155  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  38.1 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  36.26 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  36.26 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  36.26 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0542  hypothetical protein  38.11 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  37.96 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  37.64 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  36.72 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  36.33 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  36.33 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  36.36 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  36.36 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  37.31 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  37.61 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  37.18 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  37.77 
 
 		 256 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  35.97 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  35.97 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  36.32 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  37.18 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  36.96 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>