More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3372 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  524  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  84.15 
 
 
268 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  84.15 
 
 
268 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  84.15 
 
 
268 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  74.34 
 
 
270 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  73.48 
 
 
269 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  73.48 
 
 
269 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  73.48 
 
 
269 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  73.48 
 
 
269 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  73.11 
 
 
269 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  75.57 
 
 
266 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  70.3 
 
 
266 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  74.43 
 
 
266 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  69.55 
 
 
267 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  71.76 
 
 
269 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  71.76 
 
 
269 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  71.76 
 
 
269 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  71.76 
 
 
269 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  71.76 
 
 
269 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  71.76 
 
 
269 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  71.76 
 
 
269 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  72.14 
 
 
269 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  71.76 
 
 
269 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  55.69 
 
 
257 aa  287  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  55.12 
 
 
259 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  54.41 
 
 
260 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  54.72 
 
 
259 aa  274  9e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  54.88 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  55.28 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  55.28 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  56.61 
 
 
267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  54.07 
 
 
256 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  54.07 
 
 
256 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  55.37 
 
 
257 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  54.07 
 
 
256 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  54.88 
 
 
256 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  53.66 
 
 
259 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  54.88 
 
 
256 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  55.69 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  52.85 
 
 
268 aa  259  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  51.57 
 
 
259 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  54.51 
 
 
254 aa  248  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  50.23 
 
 
223 aa  241  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  49.77 
 
 
223 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  47.92 
 
 
253 aa  231  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  49.17 
 
 
251 aa  230  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  48.75 
 
 
251 aa  229  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  47.92 
 
 
253 aa  228  5e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  46.35 
 
 
256 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00918  hypothetical protein  53.15 
 
 
259 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  46.5 
 
 
261 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  45.08 
 
 
272 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  44.05 
 
 
261 aa  218  7e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  44.05 
 
 
272 aa  218  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  41.04 
 
 
261 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  46.25 
 
 
254 aa  214  8e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  45.23 
 
 
261 aa  214  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  49.17 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  43.43 
 
 
257 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  44.17 
 
 
257 aa  206  3e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1961  hypothetical protein  51.63 
 
 
261 aa  206  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  44.18 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  42.17 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2502  hypothetical protein  45.18 
 
 
252 aa  195  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  45.35 
 
 
263 aa  194  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  41.13 
 
 
254 aa  193  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  42.21 
 
 
251 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  43.85 
 
 
254 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  43.02 
 
 
263 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  40.3 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  42.64 
 
 
263 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2446  hypothetical protein  43.8 
 
 
247 aa  185  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.335155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  42.8 
 
 
249 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4374  hypothetical protein  45.08 
 
 
264 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.716093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  41.18 
 
 
256 aa  175  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  40.66 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  40.66 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  40.66 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  42.39 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  39.16 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  38.31 
 
 
256 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  39.83 
 
 
250 aa  168  8e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  40.16 
 
 
259 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  40.89 
 
 
280 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5469  hypothetical protein  42.41 
 
 
264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51215  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  40.89 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  45.9 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  38.66 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  37.15 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  38.28 
 
 
259 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  37.15 
 
 
259 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  37.15 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0542  hypothetical protein  38.52 
 
 
263 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  37.7 
 
 
261 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  39.29 
 
 
259 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0842  hypothetical protein  39.52 
 
 
262 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.213592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  37.5 
 
 
257 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  39.29 
 
 
259 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  34.15 
 
 
263 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0966  hypothetical protein  45.04 
 
 
254 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0162432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>