293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2502 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2502  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  474  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  63.49 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  59.27 
 
 		 261 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  59.27 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  57.69 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  58.08 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  50.81 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  54.03 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  50.41 
 
 		 270 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  46.56 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  46.56 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  46.56 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  46.15 
 
 		 256 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  46.96 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  46.56 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  46.15 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  46.15 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  50 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  46.12 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  46.25 
 
 		 268 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  46.25 
 
 		 268 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  46.25 
 
 		 268 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  45.53 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  44.72 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  44.8 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  50.4 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  45.53 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  51.79 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  43.32 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  43.2 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  43.2 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  43.2 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  43.2 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  43.2 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  43.2 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  44.53 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  44.31 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  44 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  48.76 
 
 		 266 aa  198  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  46.37 
 
 		 254 aa  197  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  50.88 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  45.65 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  48.35 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  45.53 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  45.53 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  45.53 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  45.53 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  45.53 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  45.53 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  45.53 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  45.53 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  45.53 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  42.34 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  43.39 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  41.95 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0542  hypothetical protein  45.16 
 
 		 263 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  39.11 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4374  hypothetical protein  48.58 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.716093 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  40.73 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  39.52 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  38 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  37.4 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  38.46 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  40.43 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  37.4 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  40.32 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  42.06 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  39.61 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  36.36 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  36.36 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  39.48 
 
 		 254 aa  158  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  38.13 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  38.13 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  38.52 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5469  hypothetical protein  44.44 
 
 		 264 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  39.3 
 
 		 280 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  35.74 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  35.74 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  39.91 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  38.89 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  38.91 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  40.56 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18220  hypothetical protein  43.7 
 
 		 289 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891224  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  37.89 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1961  hypothetical protein  42.74 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00918  hypothetical protein  41.53 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2446  hypothetical protein  38.08 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.335155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  42.91 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  36.44 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  38.79 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  34.9 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  40.43 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  42.49 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  40.48 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  37.04 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  39.53 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  37.4 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  38.52 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  35.34 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  37.08 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>