257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04790 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04790  predicted permease  100 
 
 
251 aa  486  1e-136  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.542879  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26650  predicted permease  52.21 
 
 
253 aa  237  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0286343  normal  0.726382 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  43.2 
 
 
255 aa  203  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  44.53 
 
 
252 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  39.52 
 
 
262 aa  170  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  40.97 
 
 
261 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0218  hypothetical protein  35.34 
 
 
250 aa  135  9e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0116723 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  33.33 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  34.17 
 
 
255 aa  133  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  35.37 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  33.33 
 
 
256 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  32.92 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  37.1 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  33.99 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  32.92 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  33.73 
 
 
253 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  36.78 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  34.78 
 
 
255 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  35.08 
 
 
251 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0541  hypothetical protein  34.82 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.71151  normal  0.0781963 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  35.44 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0842  hypothetical protein  37.92 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.213592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  34.9 
 
 
252 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  34.39 
 
 
255 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  33.99 
 
 
255 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  33.99 
 
 
255 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  33.47 
 
 
265 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  32.93 
 
 
265 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  34.51 
 
 
252 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1303  membrane protein  35.11 
 
 
260 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134864  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  31.85 
 
 
257 aa  124  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  33.99 
 
 
255 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  34.39 
 
 
255 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  31.69 
 
 
256 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  34.39 
 
 
255 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  31.69 
 
 
256 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  33.99 
 
 
255 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  36.03 
 
 
261 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  34.16 
 
 
253 aa  122  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  36.03 
 
 
272 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  32.4 
 
 
253 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0966  hypothetical protein  36.14 
 
 
254 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0162432  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  35.15 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  35.62 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  36.93 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  32.2 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  35.14 
 
 
252 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  34.58 
 
 
272 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  34.41 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  35.22 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  33.19 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  35.34 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  35.12 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  33.05 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  32.37 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  32.03 
 
 
251 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  31.91 
 
 
257 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  34.6 
 
 
261 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  34.6 
 
 
253 aa  115  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  35.04 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  31.75 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  31.45 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  31.45 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  35.08 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  35.24 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  31.95 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  31.45 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  31.95 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  33.2 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  32.37 
 
 
256 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  31.36 
 
 
269 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  31.36 
 
 
269 aa  113  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  34.8 
 
 
259 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  34.94 
 
 
259 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  32.62 
 
 
257 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  32.37 
 
 
256 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  31.54 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  33.47 
 
 
253 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  32.81 
 
 
257 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  35.48 
 
 
261 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  33.98 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  35 
 
 
259 aa  111  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  32.05 
 
 
256 aa  111  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  32.93 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  32.91 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  35.27 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1011  hypothetical protein  39.57 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0235479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  34.43 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  32.24 
 
 
252 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  33.89 
 
 
260 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  33.76 
 
 
254 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>