268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0177 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  490  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  83.73 
 
 		 252 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  73.81 
 
 		 252 aa  349  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  73.41 
 
 		 252 aa  348  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  73.02 
 
 		 252 aa  348  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  74.6 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  75 
 
 		 252 aa  339  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  73.02 
 
 		 253 aa  338  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  72.11 
 
 		 252 aa  335  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  67.2 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  57.14 
 
 		 252 aa  271  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  55.95 
 
 		 252 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  56.75 
 
 		 252 aa  262  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  60.71 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  57.94 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  53.82 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  52.44 
 
 		 263 aa  238  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  51.01 
 
 		 259 aa  218  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  50.4 
 
 		 253 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  50 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  49.2 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  49.19 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  43.5 
 
 		 264 aa  185  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  44.68 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  42.68 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  39.6 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  47.97 
 
 		 262 aa  175  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  40.73 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  40.65 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  41.67 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  40.08 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  39.84 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  43.29 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  39.02 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  39.02 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  41.37 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  44.18 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  38.98 
 
 		 252 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  46.53 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  39.02 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  39.43 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  39.02 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  36.86 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  45.12 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  39.5 
 
 		 261 aa  154  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  39.5 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  38.91 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  35.71 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  38.91 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  42.68 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  39.17 
 
 		 279 aa  151  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2578  hypothetical protein  43.15 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1793  hypothetical protein  40.65 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.607565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  37.61 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1064  protein of unknown function DUF81  37.04 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0832  hypothetical protein  37.86 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  37.61 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  37.18 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  37.61 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  38.63 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  37.61 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  37.61 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  37.61 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  37.61 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  36.65 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1208  protein of unknown function DUF81  43.16 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  36.48 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  38.21 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  37.29 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  38.1 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  37.18 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  37.4 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  37.4 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  36.99 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  34.58 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  37.18 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  38.84 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  37.4 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  39.24 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  38.08 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  36.75 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  38.79 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  37.4 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  39.11 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  34.66 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  35.34 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  37.02 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  40.24 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  36.4 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  35.27 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  36.59 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0959  hypothetical protein  42.45 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  36.44 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  35.68 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  31.58 
 
 		 257 aa  131  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  35.68 
 
 		 254 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  34.84 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  37.45 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  35.86 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>