More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1788 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 279 aa  527  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  66.15 
 
 		 264 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  68.09 
 
 		 264 aa  312  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  60.58 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  62.85 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  56.3 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  55.34 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0553  protein of unknown function DUF81  61.97 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06970  predicted permease  61.54 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497367  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0959  hypothetical protein  56.13 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170118  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  51.29 
 
 		 267 aa  202  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  49.8 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  46.09 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  40.54 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  48.09 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  45.23 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  46 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  40.64 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  39.84 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  40.32 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  40.32 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  40.32 
 
 		 255 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  42.63 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  42.74 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  39.52 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  42.23 
 
 		 252 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  39.11 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  39.11 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2578  hypothetical protein  47.95 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  40.32 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  39.92 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  39.92 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  38.46 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  43.82 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  37.1 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  40.66 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  40.66 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  37.1 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  36.84 
 
 		 256 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  38.49 
 
 		 261 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  36.84 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  38.52 
 
 		 254 aa  165  9e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  36.84 
 
 		 256 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  43.15 
 
 		 252 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  35.55 
 
 		 261 aa  165  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  36.69 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1793  hypothetical protein  46.58 
 
 		 254 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.607565  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  36.84 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1208  protein of unknown function DUF81  48.92 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  41.94 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  36.44 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  36.4 
 
 		 255 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  36.44 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  36.44 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  37.6 
 
 		 272 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  39.58 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  40 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  36.29 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  37.15 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  38.82 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2209  protein of unknown function DUF81  49.04 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000506184 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  37.15 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  41.83 
 
 		 252 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  36.75 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  35.83 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  39.18 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  35.46 
 
 		 257 aa  153  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  37.25 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  37.25 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  37.25 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  34.57 
 
 		 267 aa  151  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  39.68 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  39.13 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  39.13 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  35.94 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  34.57 
 
 		 261 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  38.89 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  40.46 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  38.74 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  40.46 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  40.46 
 
 		 259 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  44.68 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0832  hypothetical protein  35.29 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  40.59 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  38.06 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1064  protein of unknown function DUF81  34.84 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  37.7 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  35 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2502  hypothetical protein  39.91 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  39.46 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  38.85 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  40 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  35.02 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  35.06 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  36.36 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  38.78 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>