283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3365 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  83.33 
 
 
252 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  82.14 
 
 
252 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  84.52 
 
 
252 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  85.32 
 
 
252 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  65.04 
 
 
263 aa  314  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  60.71 
 
 
252 aa  297  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  59.68 
 
 
253 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  59.52 
 
 
252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  55.95 
 
 
252 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  58.33 
 
 
252 aa  277  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  58.33 
 
 
252 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  60.32 
 
 
252 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  57.54 
 
 
252 aa  262  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  55.38 
 
 
253 aa  257  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  56.57 
 
 
252 aa  254  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  54.25 
 
 
259 aa  241  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  52.61 
 
 
253 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  52.21 
 
 
253 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  52.21 
 
 
276 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  52.59 
 
 
251 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  51.38 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  52.21 
 
 
253 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  41.42 
 
 
254 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  46.47 
 
 
264 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  45.83 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  45.96 
 
 
260 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  46.27 
 
 
252 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  39.52 
 
 
255 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  48.78 
 
 
262 aa  179  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  48.81 
 
 
267 aa  178  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  46.59 
 
 
258 aa  178  8e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  44.1 
 
 
254 aa  178  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  42.98 
 
 
255 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  39.92 
 
 
255 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  39.09 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  40.66 
 
 
261 aa  165  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  40.66 
 
 
272 aa  165  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1793  hypothetical protein  43.12 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.607565  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  37.9 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  38.27 
 
 
255 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  38.27 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  41.94 
 
 
279 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  37.86 
 
 
255 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  37.86 
 
 
255 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  38.91 
 
 
256 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  38.91 
 
 
256 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  40.98 
 
 
270 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  35.39 
 
 
251 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  39.08 
 
 
272 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  39.5 
 
 
255 aa  158  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  37.66 
 
 
261 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  36.08 
 
 
253 aa  157  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  38.68 
 
 
255 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  38.27 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  45.9 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  38.27 
 
 
255 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  36.51 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  39.77 
 
 
252 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2578  hypothetical protein  43.27 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  35.92 
 
 
267 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1064  protein of unknown function DUF81  36.44 
 
 
254 aa  151  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  35.71 
 
 
256 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  35.29 
 
 
256 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  35.92 
 
 
269 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  34.87 
 
 
256 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  35.92 
 
 
269 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  35.92 
 
 
269 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  35.92 
 
 
269 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  35.92 
 
 
269 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  35.71 
 
 
256 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  35.29 
 
 
256 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0832  hypothetical protein  36.03 
 
 
254 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  35.29 
 
 
256 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  35.29 
 
 
256 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  35.29 
 
 
256 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  33.07 
 
 
253 aa  149  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  35.29 
 
 
256 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  39.68 
 
 
259 aa  148  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  34.87 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  40 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  38.96 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  37.2 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  37.77 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  36.4 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2209  protein of unknown function DUF81  47.2 
 
 
255 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  34.41 
 
 
266 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  35.29 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  38.93 
 
 
259 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  38.52 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  35.74 
 
 
257 aa  144  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  35.39 
 
 
268 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 
254 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  35 
 
 
255 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  32.53 
 
 
266 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  35.39 
 
 
268 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  38.52 
 
 
259 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2502  hypothetical protein  39.83 
 
 
252 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1208  protein of unknown function DUF81  46.55 
 
 
267 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  35.39 
 
 
268 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>