282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0479 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  488  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  55.24 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  54.39 
 
 
259 aa  228  9e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  48.97 
 
 
263 aa  227  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  49.6 
 
 
252 aa  224  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  49.21 
 
 
252 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  46.8 
 
 
252 aa  214  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  46.8 
 
 
252 aa  214  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  49.21 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  49.2 
 
 
252 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  49 
 
 
253 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  51 
 
 
253 aa  209  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  48.61 
 
 
276 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  47.41 
 
 
253 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  49.79 
 
 
252 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  46.8 
 
 
252 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  46.4 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  48.21 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  46.4 
 
 
252 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 
254 aa  191  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  52.74 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  45.31 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  46.99 
 
 
253 aa  188  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  47.93 
 
 
252 aa  187  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  47.97 
 
 
252 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  44.16 
 
 
262 aa  175  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  42.67 
 
 
254 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  39.43 
 
 
255 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  44.76 
 
 
252 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  44.28 
 
 
279 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  43.93 
 
 
255 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  41.99 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  43.75 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1064  protein of unknown function DUF81  39.18 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  46.05 
 
 
258 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  37.1 
 
 
256 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  36.22 
 
 
255 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  37.75 
 
 
256 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0832  hypothetical protein  38.68 
 
 
254 aa  156  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  36.99 
 
 
256 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  37.75 
 
 
256 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  37.75 
 
 
256 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  37.75 
 
 
256 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  37.75 
 
 
256 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  43.5 
 
 
264 aa  155  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  37.1 
 
 
256 aa  155  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  37.75 
 
 
256 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  36.99 
 
 
256 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  36.99 
 
 
256 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  36.78 
 
 
256 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  43.53 
 
 
286 aa  149  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  36.78 
 
 
256 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2578  hypothetical protein  46.64 
 
 
264 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  31.5 
 
 
252 aa  148  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  34.13 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  37.08 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  36.95 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1793  hypothetical protein  43.27 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.607565  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  36.48 
 
 
255 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  35.51 
 
 
261 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  36.19 
 
 
254 aa  142  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  37.35 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  37.35 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  38.87 
 
 
254 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  36.89 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  36.48 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  36.89 
 
 
255 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2209  protein of unknown function DUF81  41.33 
 
 
255 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0959  hypothetical protein  40.76 
 
 
259 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170118  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  35.23 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  36.07 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  35.23 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  35.23 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  37.04 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  36.07 
 
 
255 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  36.07 
 
 
255 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  36.48 
 
 
255 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  36.14 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  36.55 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  35.83 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  33.33 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  36.07 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1512  hypothetical protein  35.86 
 
 
257 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  37.08 
 
 
261 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  32.2 
 
 
266 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  34.65 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  36.21 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  34.65 
 
 
254 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1011  hypothetical protein  40.99 
 
 
256 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0235479 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26650  predicted permease  34.51 
 
 
253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0286343  normal  0.726382 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1303  membrane protein  36.55 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134864  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0966  hypothetical protein  38.06 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0162432  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  34.65 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  38.06 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1208  protein of unknown function DUF81  44.21 
 
 
267 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  35.34 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  34.94 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  35.74 
 
 
257 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  35.34 
 
 
257 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>