282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2209 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2209  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
255 aa  474  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  58.63 
 
 
252 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2578  hypothetical protein  64.17 
 
 
264 aa  245  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  52.97 
 
 
255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  47.84 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1793  hypothetical protein  59.24 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.607565  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  47.86 
 
 
256 aa  198  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  50.42 
 
 
279 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  41.2 
 
 
263 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  48.56 
 
 
286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  41.8 
 
 
252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  41.8 
 
 
252 aa  182  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  50 
 
 
264 aa  178  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  42.17 
 
 
252 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  48.4 
 
 
258 aa  176  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  44.67 
 
 
252 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  44 
 
 
252 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  37.8 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  43.1 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  43.82 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  42.26 
 
 
252 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  44.4 
 
 
252 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  40.24 
 
 
252 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  40.51 
 
 
260 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  43.55 
 
 
252 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  43.44 
 
 
253 aa  168  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  47.6 
 
 
267 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  35.97 
 
 
254 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  40 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  37.3 
 
 
268 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  41.25 
 
 
253 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  37.3 
 
 
268 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  39.76 
 
 
253 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  37.3 
 
 
268 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  37.05 
 
 
267 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  39.76 
 
 
276 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  40.56 
 
 
253 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  41.94 
 
 
254 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  42.91 
 
 
253 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  38.89 
 
 
261 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  44.35 
 
 
252 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  38.4 
 
 
266 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  39.32 
 
 
272 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  38 
 
 
266 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  46.67 
 
 
253 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  39.66 
 
 
261 aa  155  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  39.66 
 
 
272 aa  155  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1208  protein of unknown function DUF81  48.71 
 
 
267 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  39.34 
 
 
252 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  38.08 
 
 
255 aa  152  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  33.6 
 
 
255 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0553  protein of unknown function DUF81  48.95 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  34.8 
 
 
261 aa  151  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  35.1 
 
 
256 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  35.1 
 
 
256 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  35.1 
 
 
256 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  34.69 
 
 
256 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  34.69 
 
 
256 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  33.6 
 
 
255 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06970  predicted permease  49.8 
 
 
290 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  43.51 
 
 
252 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  34.69 
 
 
256 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  34.69 
 
 
256 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  34.69 
 
 
256 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  33.6 
 
 
255 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  32.41 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  32.41 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  34.98 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  34.98 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  32.94 
 
 
255 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  34.71 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  34.71 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  32.94 
 
 
255 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  32.94 
 
 
255 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  34.65 
 
 
259 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  34.65 
 
 
259 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  35.98 
 
 
253 aa  144  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  35.34 
 
 
257 aa  143  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  34.57 
 
 
256 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  37.65 
 
 
281 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  34.78 
 
 
259 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  39.02 
 
 
253 aa  143  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0959  hypothetical protein  41.78 
 
 
259 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  32.54 
 
 
255 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  34.65 
 
 
259 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  38 
 
 
266 aa  141  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  35.55 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  35.04 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  35.41 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  38.59 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  34.65 
 
 
259 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  31.89 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  34.55 
 
 
256 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  35.37 
 
 
269 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  35.37 
 
 
269 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  32.67 
 
 
270 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0842  hypothetical protein  38.46 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.213592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  34.36 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>