275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0520 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  98.49 
 
 		 265 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0541  hypothetical protein  94.62 
 
 		 261 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.71151  normal  0.0781963 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1303  membrane protein  56.8 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134864  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  46.19 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  41.37 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  35.1 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  38.77 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  35.02 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  37.97 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  37.97 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  37.97 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  35.71 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  36.24 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  38.75 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  35.92 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  39.75 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  34.19 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  35.9 
 
 		 266 aa  131  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  36.69 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  38.93 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  37.3 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  37.3 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  37.3 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  37.12 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  37.3 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  37.12 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  32.91 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  39.17 
 
 		 254 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  35.29 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  35.96 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  35.15 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  35.06 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  34.2 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  37.02 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  34.02 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  36.59 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  34.55 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04790  predicted permease  33.47 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.542879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26650  predicted permease  33.6 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0286343  normal  0.726382 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  36.36 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  35.95 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  34.98 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  37.78 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  36.21 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  34.62 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0966  hypothetical protein  36.99 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0162432  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  34.98 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  36.13 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  37.92 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1011  hypothetical protein  40.57 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0235479 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  36.51 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  32.6 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  32.55 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  33.04 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  35.8 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  33.2 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  35.22 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0218  hypothetical protein  33.63 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0116723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  32.68 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  34.96 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  32.68 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  32.6 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  32.6 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  35.9 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  32.6 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  32.6 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  36.17 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  32.6 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  36.05 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  35.62 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  34.87 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  35.39 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  32.54 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  35.62 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  36.17 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  34.92 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  32.79 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  33.2 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  34.53 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  34.5 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  34.53 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  32.3 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  38.5 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  32.89 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  34.71 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  34.82 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  35.04 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  35.24 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  32.89 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  32.61 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  33.47 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0842  hypothetical protein  34.23 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.213592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  33.47 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  31.33 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  31.33 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  31.33 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>