127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1137 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  481  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  48.2 
 
 
277 aa  175  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  50.22 
 
 
255 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  42.27 
 
 
260 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  42.27 
 
 
260 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  43.38 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  43.55 
 
 
254 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  42.18 
 
 
286 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  43.4 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  40 
 
 
263 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  42.29 
 
 
261 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  42.63 
 
 
261 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  41.8 
 
 
261 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  41.8 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  41.15 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  40.4 
 
 
249 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  40.09 
 
 
249 aa  128  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  38.62 
 
 
248 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  42.38 
 
 
249 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  42.38 
 
 
249 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  36.41 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  39.15 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  30.41 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  30.31 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  31.36 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  28.79 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  28.4 
 
 
263 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  30.04 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  30.04 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.74 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  30.56 
 
 
123 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  29.63 
 
 
269 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  27.97 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  28.33 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  23.74 
 
 
266 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  32.74 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  26.91 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  37.84 
 
 
119 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  26.46 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.63 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  28.77 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  26.45 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  27.31 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  26.16 
 
 
273 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  28.57 
 
 
269 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  25.99 
 
 
298 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  27.86 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  37.38 
 
 
121 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  29.32 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  29.32 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  25.28 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  25.1 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  25.1 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  24.88 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  29.01 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  35.65 
 
 
120 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  28.74 
 
 
272 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  28.2 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  33.02 
 
 
123 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  24.07 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  28.74 
 
 
265 aa  49.3  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  24.06 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  30.56 
 
 
260 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  30.97 
 
 
260 aa  48.5  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  28.15 
 
 
310 aa  48.5  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  30.36 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  30.52 
 
 
268 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  24.06 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  29.12 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  34.26 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2767  hypothetical protein  31.82 
 
 
131 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209504  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  31.58 
 
 
307 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  31.78 
 
 
261 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  23.28 
 
 
275 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  25.93 
 
 
117 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.64 
 
 
2798 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  24.77 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  26.62 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5416  protein of unknown function DUF81  25.7 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.764981 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  32.46 
 
 
123 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  29.01 
 
 
267 aa  45.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  29.67 
 
 
255 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  29.55 
 
 
255 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  31.25 
 
 
121 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  36.11 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  35.78 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  25.2 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  23.85 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  27.87 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  28.85 
 
 
307 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0348  hypothetical protein  23.04 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.01487  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  27.16 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  29.63 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  30.84 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  32.11 
 
 
121 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  30.17 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  29.63 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>