More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0615 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  463  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  31.87 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  32.08 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2210  protein of unknown function DUF81  29.83 
 
 
276 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000833902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  41.04 
 
 
255 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  35.06 
 
 
280 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  41.13 
 
 
255 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  29.89 
 
 
275 aa  104  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  30.16 
 
 
277 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  39.53 
 
 
255 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  30.86 
 
 
283 aa  102  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 
281 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  33.58 
 
 
271 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  32.31 
 
 
2798 aa  99  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  31.75 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  31.16 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  31.45 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3317  hypothetical protein  28.57 
 
 
278 aa  96.7  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  32.05 
 
 
286 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  32.05 
 
 
289 aa  95.9  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  34.27 
 
 
283 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1197  hypothetical protein  31.5 
 
 
277 aa  95.9  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  31.75 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3869  protein of unknown function DUF81  30.26 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0185467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3310  protein of unknown function DUF81  29.84 
 
 
278 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251637  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  28.57 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  28.72 
 
 
286 aa  85.9  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3912  hypothetical protein  31.06 
 
 
278 aa  85.5  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0103404  normal  0.04978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  34.57 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3785  hypothetical protein  35.47 
 
 
278 aa  78.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.29044  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  32.55 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  29.91 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  31.76 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  30.09 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  31.76 
 
 
260 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  28.74 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  31.28 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  29.25 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  28.35 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  28.52 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1253  hypothetical protein  26.92 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0309797  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  29.54 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  29.3 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0549  hypothetical protein  27.38 
 
 
284 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.50892  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  30.59 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  24.82 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  28.45 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  28.69 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  29.51 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  29.85 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  28.46 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  26.59 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0350  hypothetical protein  29.18 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.569442  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  30.66 
 
 
291 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1233  hypothetical protein  44.57 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0611  hypothetical protein  29.94 
 
 
294 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  30.66 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  30.66 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  27.41 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0943  hypothetical protein  35.85 
 
 
332 aa  63.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.829697  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  27.41 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  23.79 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  23.79 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  29.59 
 
 
299 aa  62.4  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  27.85 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  28.45 
 
 
267 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  32.41 
 
 
282 aa  62  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  27.62 
 
 
259 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  27.62 
 
 
259 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0412  hypothetical protein  33.12 
 
 
332 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.646305 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2328  protein of unknown function DUF81  28.06 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  28.51 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  32.62 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2767  hypothetical protein  39.42 
 
 
131 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209504  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  24.47 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  25.42 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  32.71 
 
 
278 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  24.05 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  31.17 
 
 
291 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1963  hypothetical protein  26.86 
 
 
305 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0378634  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  28.46 
 
 
265 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  26.74 
 
 
264 aa  59.3  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  30.74 
 
 
291 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0366  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  58.9  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  27.38 
 
 
260 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1842  protein of unknown function DUF81  30.48 
 
 
324 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.130141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  27.59 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  28.41 
 
 
268 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  26.95 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  31.91 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  31.91 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  29.24 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  26.72 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  29.32 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  24.58 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  27.08 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  27.93 
 
 
272 aa  56.6  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>