More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0457 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  590  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  61.39 
 
 
308 aa  352  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  61.67 
 
 
310 aa  350  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  59.93 
 
 
307 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  59.8 
 
 
305 aa  348  8e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  59.6 
 
 
307 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  61.92 
 
 
307 aa  341  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  59.93 
 
 
307 aa  341  8e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  58.88 
 
 
306 aa  339  4e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  58 
 
 
306 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  61.54 
 
 
316 aa  330  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  57.67 
 
 
306 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  61.87 
 
 
316 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  60.47 
 
 
306 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  58.33 
 
 
330 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  58 
 
 
306 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  52.15 
 
 
308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  53.11 
 
 
308 aa  305  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  61.13 
 
 
307 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  51.96 
 
 
307 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  57.62 
 
 
307 aa  302  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  51.31 
 
 
307 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  50.5 
 
 
343 aa  295  6e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  50.33 
 
 
320 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  51.33 
 
 
315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  50.81 
 
 
307 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  51.99 
 
 
304 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  50.83 
 
 
304 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  51.15 
 
 
307 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  52.15 
 
 
308 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  50.65 
 
 
307 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  43.61 
 
 
305 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  47.65 
 
 
312 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  43.58 
 
 
296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  45.48 
 
 
303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  43.81 
 
 
301 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  35.6 
 
 
313 aa  163  3e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  33.92 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  32.03 
 
 
350 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  30.86 
 
 
352 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  31.03 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  28.29 
 
 
356 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  29 
 
 
415 aa  96.3  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  28.57 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  29.8 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  30.74 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  29.28 
 
 
356 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  28.99 
 
 
427 aa  92.4  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  28.95 
 
 
349 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  28.19 
 
 
345 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  35.56 
 
 
289 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  26.1 
 
 
420 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  26.24 
 
 
300 aa  89.7  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  30.15 
 
 
261 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  26.57 
 
 
394 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  28.16 
 
 
354 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  25.89 
 
 
426 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  27.64 
 
 
257 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  27.6 
 
 
361 aa  85.9  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  27.82 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  30.66 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  23.94 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  23.94 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.9 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  32.59 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  26.69 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  27.64 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  34.07 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  26.38 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  28.68 
 
 
261 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  28.15 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  28.31 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  28.15 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  25.31 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  26.24 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  28.38 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  28.31 
 
 
261 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  28.15 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  27.94 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  27.78 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  27.31 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  24.24 
 
 
2798 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  27.14 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  26.04 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  25.64 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  28.04 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  26.06 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  25.84 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  25.84 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  25.09 
 
 
354 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  26.79 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  27.2 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  28.33 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  24.61 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  29.39 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  27.67 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  27.67 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  27.63 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>