192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3494 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  99.62 
 
 		 261 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  98.08 
 
 		 261 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  96.55 
 
 		 261 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  77.78 
 
 		 261 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  75.48 
 
 		 261 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  75.1 
 
 		 266 aa  358  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  63.22 
 
 		 260 aa  305  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  60.24 
 
 		 260 aa  271  9e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  56.86 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  56.76 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  50.57 
 
 		 289 aa  225  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  46.61 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  54.94 
 
 		 262 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  46.64 
 
 		 256 aa  218  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  56.86 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  54.15 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  54.15 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  54.15 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  54.15 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  54.15 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  54.15 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  54.15 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  55.64 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  55.64 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  55.69 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  50.94 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  55 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  51.07 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  53.36 
 
 		 262 aa  201  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  54.15 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  57.02 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  57.02 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  56.6 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  54.33 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  47.04 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  51.37 
 
 		 264 aa  191  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  48.62 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  45.17 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  48.45 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  50.39 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  47.83 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  44.16 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  44.57 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  44.16 
 
 		 253 aa  175  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  44.49 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  43.75 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  42.86 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  38.85 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  42.55 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  38.55 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  37.93 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  44.59 
 
 		 257 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  46.96 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  44.83 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  39.13 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  35.55 
 
 		 317 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  34.88 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  35.34 
 
 		 323 aa  128  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  39.45 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  38.76 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  32.81 
 
 		 329 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  38.34 
 
 		 307 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  36.88 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  32.94 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  33.2 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  29.84 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  48.28 
 
 		 131 aa  93.6  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  46.53 
 
 		 119 aa  81.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  30.94 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  30.26 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  30.26 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  27.51 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  27.9 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  30.31 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  28.85 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  29.69 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  26.39 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  27.99 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.77 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  26.55 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  38.1 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  24.72 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  38.1 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  28.85 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  38.1 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  26.32 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  24.32 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  37.65 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  37.65 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  26.02 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  26.32 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  26.39 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  46.97 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  25.98 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  26.1 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  43.24 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  32.98 
 
 		 119 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>