223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2642 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  578  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  75.33 
 
 
315 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  70.43 
 
 
304 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  53.31 
 
 
306 aa  293  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  52.65 
 
 
307 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  52.98 
 
 
307 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  53.64 
 
 
307 aa  288  8e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  56.58 
 
 
330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  53.97 
 
 
307 aa  281  8.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  52.63 
 
 
307 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  52.32 
 
 
308 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  51 
 
 
305 aa  275  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  51.99 
 
 
307 aa  268  8e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  50.17 
 
 
306 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  50.17 
 
 
306 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  50.67 
 
 
306 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  49.67 
 
 
310 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  52.82 
 
 
306 aa  258  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  52.84 
 
 
316 aa  258  9e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  52.17 
 
 
316 aa  255  6e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  44.85 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  50.17 
 
 
312 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  46.89 
 
 
320 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  46.03 
 
 
307 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  45.85 
 
 
305 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  45.36 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  44.85 
 
 
343 aa  232  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  45.7 
 
 
308 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  52.65 
 
 
307 aa  231  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  45.89 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  46.84 
 
 
307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  45.51 
 
 
307 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  47.18 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  44.52 
 
 
308 aa  196  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  42.23 
 
 
303 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  44.85 
 
 
301 aa  162  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  33.11 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
342 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  32.22 
 
 
350 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  29.7 
 
 
346 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  30.42 
 
 
345 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  30.34 
 
 
352 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  30.51 
 
 
349 aa  93.2  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  27.8 
 
 
354 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 
350 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  27.65 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  30.74 
 
 
339 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  30.43 
 
 
356 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  27.57 
 
 
356 aa  89  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  28.68 
 
 
350 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  31.69 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  27.48 
 
 
415 aa  86.3  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  33.63 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  27.44 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  30.28 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  27.34 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  27.94 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  30.17 
 
 
361 aa  79  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  26.07 
 
 
426 aa  79  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  27.8 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  33.8 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  29.41 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  26.6 
 
 
420 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  29.46 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  25.27 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  28.04 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  27.64 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  26.47 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  23.81 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  27.37 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.09 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  22.07 
 
 
2798 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  26.07 
 
 
415 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  27.99 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  27.86 
 
 
255 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  22.18 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  26.12 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  23.42 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  23.33 
 
 
257 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  22.3 
 
 
251 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  22.3 
 
 
251 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  29.37 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  27.35 
 
 
317 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  22.22 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  32.43 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  38.46 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  34.13 
 
 
260 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2888  protein of unknown function DUF81  26.22 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  25.52 
 
 
261 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  34.13 
 
 
260 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  25.85 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  27.96 
 
 
293 aa  53.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  30.63 
 
 
254 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  29.33 
 
 
280 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  24.53 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  27.82 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  34.13 
 
 
260 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  35.05 
 
 
266 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  22.96 
 
 
275 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>