202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4610 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  92.51 
 
 		 307 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  86.32 
 
 		 308 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  86.64 
 
 		 320 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  76.32 
 
 		 343 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  76.55 
 
 		 308 aa  441  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  77.27 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  55.81 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  56.72 
 
 		 308 aa  318  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  61.24 
 
 		 307 aa  315  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  55.81 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  54.82 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  55.48 
 
 		 307 aa  309  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  51.31 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  51.16 
 
 		 307 aa  288  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  50.81 
 
 		 310 aa  281  7.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  55.15 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  49.84 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  54.18 
 
 		 316 aa  276  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  53.85 
 
 		 316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  50.17 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  49.83 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  55.96 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  51.16 
 
 		 306 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  50.83 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  48.84 
 
 		 307 aa  251  9.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  56.29 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  44.52 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  52.16 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  46.03 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  45.03 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  41.78 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  41.36 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  43.52 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  40.8 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  33.77 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  41.81 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  33.44 
 
 		 342 aa  106  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  31.48 
 
 		 352 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  29.45 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 339 aa  89  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  28.32 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  28.92 
 
 		 420 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  29.89 
 
 		 356 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  27.95 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  29.35 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  25.94 
 
 		 426 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  24.44 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  27.27 
 
 		 427 aa  79  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  26.06 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  27.74 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  24.33 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  26.86 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  25.93 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  26.62 
 
 		 428 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  25.58 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  25.87 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  27.84 
 
 		 415 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  26.28 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  21.95 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  23.57 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  26.42 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  22.55 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  27.43 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  28.99 
 
 		 261 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  28.99 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  28.1 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  24.91 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  28.62 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  26.3 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  24.71 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  28.99 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  22.68 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  28.26 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  29.3 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  26.01 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  23.93 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  23.93 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  29.6 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  23.97 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  25.55 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2888  protein of unknown function DUF81  23.81 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  23.35 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  23.35 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  24.6 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.13 
 
 		 2798 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  28.44 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  24.65 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  23.46 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  23.03 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  29.96 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  24.61 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  28.44 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  26.57 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  34.43 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0872  hypothetical protein  22.46 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  25 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.1 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>