167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1666 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  47.43 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  48.65 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  47.35 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  43.58 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  43.75 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  45.7 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  47.53 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  43.02 
 
 		 266 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  43.04 
 
 		 260 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  42.05 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  44.92 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  44.88 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  44.88 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  43.92 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  50 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  41.11 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  44.88 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  39.75 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  44.92 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  39.75 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  44.21 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  37.55 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  42.97 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  42.97 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  42.97 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  42.13 
 
 		 262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  42.97 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  42.29 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  43.36 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  43.36 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  42.29 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  36.65 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  42.29 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  40.09 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  39.55 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  42.29 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  42.29 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  42.29 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  42.29 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  43.36 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  38.31 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  41.38 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  39 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  42.15 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  39.39 
 
 		 309 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  42.35 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  42.15 
 
 		 262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  37.5 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  41.03 
 
 		 262 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  38.14 
 
 		 257 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  36.25 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  40.6 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  40.6 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  43.3 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  37.02 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  37.02 
 
 		 317 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  42.04 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  37.77 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  36.22 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  32.27 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  31.68 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  30.88 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  32.68 
 
 		 307 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  31.3 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  31.54 
 
 		 329 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  48.18 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  53.75 
 
 		 119 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  26.94 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  29.41 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  25.36 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  29.46 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  35.38 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  28.44 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  35.38 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  31.73 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  26.45 
 
 		 274 aa  62  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  24.46 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  25.72 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  25.76 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  25.76 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  24.57 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  24.52 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  25.53 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  25.19 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  29.66 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  25.46 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  24.36 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  24.18 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  24.31 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  26.82 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  24.18 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  32.33 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  24.91 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  28.11 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  24.35 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  23.13 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>