171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0737 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  99.24 
 
 
262 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  97.71 
 
 
262 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  96.18 
 
 
262 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  95.42 
 
 
262 aa  400  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  95.04 
 
 
262 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  95.04 
 
 
262 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  81.44 
 
 
264 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  81.3 
 
 
262 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  81.3 
 
 
262 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  80.92 
 
 
262 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  80.92 
 
 
262 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  80.92 
 
 
262 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  80.92 
 
 
262 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  80.92 
 
 
262 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  79.39 
 
 
262 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  79.77 
 
 
262 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  77.1 
 
 
262 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  62.02 
 
 
266 aa  274  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  63.18 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  60.32 
 
 
261 aa  245  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  54.15 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  55.64 
 
 
261 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  55.25 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  55.64 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  53.38 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  58.37 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  59.14 
 
 
262 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  55.64 
 
 
261 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  51.38 
 
 
260 aa  227  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  50.57 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  50.97 
 
 
261 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  48.44 
 
 
255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  51.34 
 
 
266 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  50.87 
 
 
257 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  43.41 
 
 
253 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  46.81 
 
 
260 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  50.76 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  50.38 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  48.26 
 
 
253 aa  198  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  51.29 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  50.43 
 
 
257 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  47.37 
 
 
266 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  49.61 
 
 
264 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  47.47 
 
 
263 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  52.12 
 
 
263 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  51.69 
 
 
263 aa  188  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  53.91 
 
 
264 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  49.57 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  48.52 
 
 
263 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  52.78 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  42.64 
 
 
261 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  42.15 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  39.84 
 
 
317 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  44.44 
 
 
262 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  40.54 
 
 
325 aa  155  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  35.6 
 
 
257 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  34.14 
 
 
257 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  34.82 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  38.76 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  42.69 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  35.55 
 
 
263 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  40.64 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  38.28 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  37.05 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  36.25 
 
 
323 aa  122  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  34.92 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  33.47 
 
 
250 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  54.46 
 
 
131 aa  102  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  49.02 
 
 
119 aa  89  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  34.65 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  30.85 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  30.85 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  25.5 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  29.6 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.48 
 
 
266 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  27.01 
 
 
304 aa  58.9  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  25.83 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  25.93 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  24.36 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  25.71 
 
 
268 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  27.41 
 
 
294 aa  55.8  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  28.45 
 
 
260 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  23.53 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  23.93 
 
 
298 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  27.04 
 
 
315 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  27.6 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7258  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  28.57 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  26.98 
 
 
300 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  25.71 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  27.9 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  26.34 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  26.81 
 
 
260 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  26.05 
 
 
306 aa  52.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  26.81 
 
 
267 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  30.43 
 
 
275 aa  52  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  27.13 
 
 
306 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  35.45 
 
 
346 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>