151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1111 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  502  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  59.7 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  53.78 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  56.13 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  56.52 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  56.13 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  54.83 
 
 		 261 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  55.34 
 
 		 266 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  52.53 
 
 		 260 aa  234  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  54.15 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  54.92 
 
 		 260 aa  231  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  53.75 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  52.43 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  48.25 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  52.17 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  51.48 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  48.03 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  49.79 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  49.58 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  53.91 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  50 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  53.91 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  53.91 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  53.91 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  53.91 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  53.91 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  53.91 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  53.91 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  53.91 
 
 		 262 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  53.91 
 
 		 262 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  53.52 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  46.43 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  51.36 
 
 		 264 aa  195  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  52.34 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  50.98 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  52.51 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  53.52 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  53.12 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  47.48 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  47.29 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  51.75 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  44.61 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  47.45 
 
 		 263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  53.52 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  45.61 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  53.52 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  53.52 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  48.54 
 
 		 263 aa  174  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  47.7 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  50.97 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  47.01 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  39.92 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  42.41 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  47.2 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  35.74 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  36.9 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  42.68 
 
 		 332 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  41.3 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  45.32 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  39.61 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  42.21 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  40.16 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  36.11 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  34.21 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  34.12 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  34.13 
 
 		 329 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  52.94 
 
 		 131 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  30.16 
 
 		 250 aa  102  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  58.06 
 
 		 119 aa  96.3  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  34.91 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  29.2 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  30.51 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  30.15 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  30.15 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  28.8 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.17 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  26.77 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  29.2 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  28.8 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  29.3 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  31.62 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  31.44 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  31.44 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  31.52 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  26.62 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7258  protein of unknown function DUF81  28.17 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  28.45 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  27.67 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  26.33 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  26.88 
 
 		 307 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  28.35 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  28.16 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  28.69 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  26.88 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  35.96 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  35.96 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  24.91 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  23.81 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>