123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2253 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  467  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  46.3 
 
 
266 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  50.58 
 
 
262 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  50.97 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  50.58 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  50.58 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  50.58 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  50.58 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  50.58 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  53.75 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  51.37 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  53.75 
 
 
262 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  52.78 
 
 
262 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  45.28 
 
 
256 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  52.78 
 
 
262 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  52.78 
 
 
262 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  52.38 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  47.84 
 
 
261 aa  178  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  46.03 
 
 
261 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  47.31 
 
 
260 aa  175  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  50.79 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  44.7 
 
 
289 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  45.04 
 
 
267 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  43.7 
 
 
260 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  48.65 
 
 
262 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  46.09 
 
 
261 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  46.48 
 
 
261 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  46.09 
 
 
261 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  45.45 
 
 
266 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  49.24 
 
 
262 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  46.48 
 
 
261 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  45.06 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  45.91 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  51.72 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  51.29 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  51.29 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  36.19 
 
 
257 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  43.08 
 
 
255 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  37.35 
 
 
253 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  45.45 
 
 
264 aa  152  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  42.01 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  42.91 
 
 
264 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  35.41 
 
 
257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  42.24 
 
 
257 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  41.25 
 
 
264 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  39.57 
 
 
257 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  43.58 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  41.38 
 
 
257 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  44.4 
 
 
263 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  35.37 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  41.67 
 
 
261 aa  138  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  38.7 
 
 
253 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  41.18 
 
 
260 aa  136  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  39.37 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  39.33 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  35.29 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  37.75 
 
 
317 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  37.64 
 
 
269 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  40.54 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  35.18 
 
 
325 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  33.6 
 
 
263 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  34.71 
 
 
332 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  36.4 
 
 
309 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  30 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  34.66 
 
 
329 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  32.55 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  28.34 
 
 
250 aa  92  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  34.93 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  48.04 
 
 
119 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  43.24 
 
 
131 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  33.47 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  26.55 
 
 
298 aa  52  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  30.77 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  25.45 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  30.77 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  30.88 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  29.92 
 
 
294 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  27.9 
 
 
420 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  30.4 
 
 
260 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  36.51 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  36.51 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  28.15 
 
 
305 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  28.15 
 
 
296 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  29.03 
 
 
415 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  40.3 
 
 
268 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  37.88 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  26.89 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  29.54 
 
 
315 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  25.09 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  39.19 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  38.78 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  29.75 
 
 
415 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  36.17 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  26.04 
 
 
273 aa  43.9  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  39.19 
 
 
345 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  26.09 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  36.67 
 
 
308 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  28.46 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  29.66 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>