177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6931 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
268 aa  518  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  60.37 
 
 
277 aa  265  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  54.48 
 
 
267 aa  249  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  52.08 
 
 
266 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  45.28 
 
 
265 aa  227  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  49.16 
 
 
268 aa  211  7.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  42.42 
 
 
266 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  43.62 
 
 
261 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  39.92 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  35.56 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  37.6 
 
 
291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  37.6 
 
 
291 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  37.6 
 
 
291 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  37.34 
 
 
257 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  38.85 
 
 
291 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  38.46 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  38.17 
 
 
254 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  38.13 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  35.77 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  35.44 
 
 
303 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  35.45 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  32.92 
 
 
301 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  34.18 
 
 
299 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  41.77 
 
 
296 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
302 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  36.02 
 
 
250 aa  99.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  38.11 
 
 
252 aa  98.6  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  34.02 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  38.17 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  33.61 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  37.08 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  30.67 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  33.46 
 
 
277 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  34.13 
 
 
275 aa  85.5  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  31.09 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  37.5 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  33.48 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  33.07 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  30.3 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  29.21 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  28.84 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  25.97 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  27.84 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  26.32 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  28.63 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  34.82 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  29.09 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  29.09 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  28.9 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  25.75 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  25 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  29.09 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  28.73 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  29.09 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  29.14 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  31.85 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  27.52 
 
 
247 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  31.53 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  30.83 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2645  protein of unknown function DUF81  33.08 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000890995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  31.21 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  28.57 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  28.73 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  29.07 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  28.26 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  27.13 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  30.32 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.52 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  28 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  32.34 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  28.46 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  29.74 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  30.47 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  28.46 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  28.46 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  30.15 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  24.91 
 
 
331 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  32.67 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  31.86 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  27.12 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  29.63 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  27.9 
 
 
268 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  30.41 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.04 
 
 
2798 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  24.31 
 
 
273 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  27.64 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2432  hypothetical protein  55.1 
 
 
252 aa  52  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  27.32 
 
 
253 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  22.71 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0941  hypothetical protein  24.8 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.892204  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  29.67 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  25.53 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  30.86 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  29.79 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  29.29 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  26.45 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  25.56 
 
 
272 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.397221 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>