127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1480 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  507  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  61.8 
 
 		 257 aa  281  9e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  66.81 
 
 		 257 aa  278  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  65.95 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  60.34 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  62.93 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  49.02 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  48.41 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  49.43 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  88.6 
 
 		 119 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  42.31 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  43.14 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  46.98 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  44.44 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  44.91 
 
 		 266 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  49.61 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  47.06 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  50 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  50 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  49.61 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  45.49 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  49.41 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  47.06 
 
 		 262 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  42.69 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  41.11 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  48.24 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  42.29 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  40.24 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  44.53 
 
 		 261 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  48.24 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  48.24 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  44.14 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  47.81 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  48.24 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  48.24 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  48.24 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  48.24 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  86.32 
 
 		 131 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  43.75 
 
 		 261 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  46.64 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  43.75 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  45.38 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  46.27 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  47.24 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  46.46 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  47.44 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  47.44 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  47.44 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  44.86 
 
 		 263 aa  162  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  48.06 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  37.07 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  36.14 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  43.36 
 
 		 261 aa  152  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  37.55 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  42.02 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  41.18 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  33.07 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  41.44 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  36.25 
 
 		 332 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  35.66 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  37.25 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  35.56 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  42.11 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  34.66 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  32.71 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  31.62 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  35.85 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  30.92 
 
 		 250 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  29.28 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  32.43 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  32.31 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  28.26 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  29.63 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  29.41 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  28.41 
 
 		 273 aa  62  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  29.89 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  29.89 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.52 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  28.31 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.83 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.32 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  27.7 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7258  protein of unknown function DUF81  26.24 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  38.36 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  38.36 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  25.27 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  27.27 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  28.32 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  39.68 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  29.44 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  26.47 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  28.67 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  28.67 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  35.96 
 
 		 415 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  32.97 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  39.73 
 
 		 415 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  27.74 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  27.63 
 
 		 420 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>