153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2817 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  93.77 
 
 		 257 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  78.21 
 
 		 257 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  73.16 
 
 		 253 aa  346  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  77.43 
 
 		 257 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  66.27 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  51.54 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  51.17 
 
 		 266 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  48.45 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  48.69 
 
 		 289 aa  211  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  53.12 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  50.78 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  53.52 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  53.52 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  53.12 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  52.14 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  43.8 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  52.34 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  51.91 
 
 		 264 aa  198  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  51.38 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  51.56 
 
 		 262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  51.38 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  51.38 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  51.38 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  51.38 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  51.38 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  51.38 
 
 		 264 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  51.98 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  45.7 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  44.92 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  42.58 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  44.92 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  41.6 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  44.92 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  46.1 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  48.05 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  43.78 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  46.43 
 
 		 263 aa  184  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  44.87 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  52.73 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  41.27 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  52.73 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  52.73 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  43.14 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  43.63 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  48.83 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  46.88 
 
 		 264 aa  175  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  45.42 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  36.54 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  41.77 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  36.96 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  36.55 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  39.2 
 
 		 317 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  41.08 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  44.98 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  36.76 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  36.58 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  40.39 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  42.92 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  36.36 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  71.05 
 
 		 131 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  64.42 
 
 		 119 aa  135  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  41.89 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  37.85 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  38.71 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  32.94 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  33.07 
 
 		 263 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  36.78 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  29.72 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  31.62 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  36.4 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  27.37 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  29.63 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  27.41 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  27.84 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  37.21 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  37.21 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  42.86 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  27.56 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7258  protein of unknown function DUF81  26.34 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  26.24 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  25.86 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  26.67 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.67 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  27.78 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  24.34 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  27.21 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  27.2 
 
 		 310 aa  52  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  29.25 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  28.85 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  31.15 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  29.5 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  29.09 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  30.74 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.48 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  31.37 
 
 		 415 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  21.49 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>