118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0855 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  465  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  38.91 
 
 
255 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  33.2 
 
 
263 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  28.98 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  27.89 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  30.54 
 
 
257 aa  108  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  36.9 
 
 
260 aa  101  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  36 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  32.95 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  35.63 
 
 
289 aa  96.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  32.54 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  32.54 
 
 
261 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  32.67 
 
 
261 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  36.21 
 
 
263 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  31.89 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  32.14 
 
 
261 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  32.69 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  32.16 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  35.43 
 
 
266 aa  88.6  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  32.16 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  33.62 
 
 
260 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  32.48 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  34.3 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  34.91 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  34.91 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  27.34 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  34.48 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  33.05 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  35.59 
 
 
264 aa  82  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  26.88 
 
 
309 aa  82  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  32.08 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  36.68 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  31.2 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  36.24 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  31.2 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  31.2 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  31.2 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  31.2 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  31.2 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  33.62 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  31.75 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  34.05 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  31.2 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  30.6 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  34.55 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  32.77 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  32.63 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  33.05 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  34.34 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  34.18 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  33.8 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  33.19 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  35.91 
 
 
332 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  31.6 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  31.22 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  33.62 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  31.94 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  33.19 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  33.19 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  34.87 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  31.44 
 
 
317 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  27.24 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  34.25 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  29.65 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  28.7 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  28.34 
 
 
325 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  40 
 
 
119 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  29.36 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  31.1 
 
 
329 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  29.74 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  37.78 
 
 
498 aa  52.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  26.55 
 
 
288 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  24.62 
 
 
286 aa  52  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  28.02 
 
 
343 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.14 
 
 
307 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  27.78 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  22.82 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  27.34 
 
 
305 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  27.34 
 
 
296 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  28.81 
 
 
307 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  23.81 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  26.34 
 
 
301 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  25.2 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0852  protein of unknown function DUF81  26.29 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  28.57 
 
 
303 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  25.65 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  27.24 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  28.17 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  24.8 
 
 
306 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  28.4 
 
 
304 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.29 
 
 
266 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  28.69 
 
 
307 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  24.3 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  31.58 
 
 
300 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  37.5 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  20.96 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  20.96 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  26.02 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  30.4 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>