More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3090 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  100 
 
 		 498 aa  994    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  51.44 
 
 		 392 aa  267  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  46.67 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  44.73 
 
 		 312 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  41.98 
 
 		 246 aa  208  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  50 
 
 		 197 aa  207  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  53.16 
 
 		 193 aa  206  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  51.61 
 
 		 188 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  44.26 
 
 		 293 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  41.55 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  43.48 
 
 		 295 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  43.02 
 
 		 335 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4780  siroheme synthase  48.96 
 
 		 195 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000392652  hitchhiker  0.00414073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  46.15 
 
 		 300 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  43.7 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  43.88 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  43.88 
 
 		 325 aa  183  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  44.12 
 
 		 239 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  41.35 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  36.59 
 
 		 250 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  46.58 
 
 		 305 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  38.26 
 
 		 253 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1506  siroheme synthase  42.86 
 
 		 194 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  48.05 
 
 		 305 aa  159  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  38.93 
 
 		 262 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 		 243 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  36.6 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  35.95 
 
 		 258 aa  153  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  40.69 
 
 		 255 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  37.3 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  38.71 
 
 		 294 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  38.37 
 
 		 299 aa  150  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  37.7 
 
 		 399 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  38.93 
 
 		 288 aa  150  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  37.7 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  37.7 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  37.3 
 
 		 336 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  37.7 
 
 		 300 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  37.3 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  36.89 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  36.89 
 
 		 300 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  35.74 
 
 		 257 aa  147  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  36.48 
 
 		 300 aa  146  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  34.71 
 
 		 303 aa  146  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  34.3 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  40.49 
 
 		 255 aa  140  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  36.59 
 
 		 319 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  39.68 
 
 		 307 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  35.74 
 
 		 304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  36.51 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 		 324 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 295 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  32.68 
 
 		 299 aa  127  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  34.71 
 
 		 312 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  34.71 
 
 		 312 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  34.71 
 
 		 312 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  37.86 
 
 		 317 aa  126  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 		 333 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  37.45 
 
 		 319 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  37.39 
 
 		 293 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  34.45 
 
 		 320 aa  123  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  40.76 
 
 		 200 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  35.98 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  38.78 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  36.33 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  39.69 
 
 		 319 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  38.65 
 
 		 280 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  42.25 
 
 		 218 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  37.13 
 
 		 209 aa  104  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  39.46 
 
 		 213 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  35.76 
 
 		 489 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  36.32 
 
 		 298 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  33.76 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  35.15 
 
 		 188 aa  103  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  34.15 
 
 		 246 aa  100  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  35.48 
 
 		 303 aa  97.8  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  32.4 
 
 		 213 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  33.68 
 
 		 303 aa  97.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  37.42 
 
 		 493 aa  96.3  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  35.26 
 
 		 303 aa  94.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  36.6 
 
 		 303 aa  94.7  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  37.66 
 
 		 303 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  37.91 
 
 		 303 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  36.6 
 
 		 303 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  38.55 
 
 		 220 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  36.6 
 
 		 303 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  36.6 
 
 		 303 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  36.6 
 
 		 303 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  33.11 
 
 		 221 aa  91.3  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.02 
 
 		 462 aa  90.9  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  31.76 
 
 		 225 aa  90.5  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  30.77 
 
 		 257 aa  90.5  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  37.01 
 
 		 303 aa  90.1  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34 
 
 		 481 aa  90.1  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  27.81 
 
 		 182 aa  90.1  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  36.3 
 
 		 212 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  34.69 
 
 		 228 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  32.67 
 
 		 229 aa  88.2  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  88.2  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.43 
 
 		 626 aa  88.6  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>