119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5363 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  68.5 
 
 		 258 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  52.46 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  48.39 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  47.54 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  46.61 
 
 		 243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  44 
 
 		 246 aa  204  8e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  48.71 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  42.46 
 
 		 294 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  41.56 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  48.18 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  41.53 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  41.53 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  46.09 
 
 		 288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  41.53 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  41.37 
 
 		 399 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  44.81 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  46.89 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  44.81 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  46.22 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  40.32 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  40.32 
 
 		 300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  40.56 
 
 		 399 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  40.16 
 
 		 369 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  40.32 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  40.16 
 
 		 336 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  41.13 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  38.15 
 
 		 392 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  43.37 
 
 		 325 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  38.46 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  43.78 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  46.61 
 
 		 304 aa  168  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  41.67 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  45.28 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  45.28 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  45.28 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  38.11 
 
 		 295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  45.24 
 
 		 311 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  39.75 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  41.27 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  37.2 
 
 		 355 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  38.67 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  41.86 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  46.22 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  37.55 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  35.74 
 
 		 498 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  49.17 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  44.62 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  44.88 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  42.47 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  44.22 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  41.5 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  42.8 
 
 		 320 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  44.3 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  43.83 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 		 319 aa  138  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  43.03 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  44.85 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  42.8 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  42.29 
 
 		 298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  42.37 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  30 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  32.41 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  31.48 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  32.41 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  32.41 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  32.41 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  32.41 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  32.41 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  24.63 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  24.63 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  28.22 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  30.89 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  24.14 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  30.15 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  27.12 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  28.43 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  27.78 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  30.2 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  29.05 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  23.15 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  32.43 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  23.15 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  24 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  28.46 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  23.15 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  28.07 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  28.07 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  25.12 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  23.81 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  27.19 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  27.19 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  27.19 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  27.19 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  27.19 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  31.53 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  27.15 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  25.4 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  33.01 
 
 		 303 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>