73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23150 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  100 
 
 		 303 aa  577  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  54.01 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  56.9 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  57.29 
 
 		 317 aa  271  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  54.55 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  58.99 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  49.34 
 
 		 299 aa  265  7e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  54.55 
 
 		 307 aa  265  8e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  49.83 
 
 		 294 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  55.59 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  56.16 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  49.66 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  54.55 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  54.55 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  54.55 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  48.84 
 
 		 399 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  49.17 
 
 		 300 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  49.17 
 
 		 300 aa  261  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  49.17 
 
 		 399 aa  261  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  48.51 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  49.17 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  48.18 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  48.51 
 
 		 336 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  55.21 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  48.51 
 
 		 300 aa  258  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  55.67 
 
 		 333 aa  258  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  54.67 
 
 		 311 aa  258  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  50.18 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  55.34 
 
 		 295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  56.63 
 
 		 312 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  53.02 
 
 		 298 aa  242  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  57.19 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  53.16 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  51.83 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  52.72 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  45.69 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  42.46 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  47.41 
 
 		 258 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  45.31 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  44.87 
 
 		 257 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  43.41 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  40.64 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  39.06 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  38.82 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  41.83 
 
 		 243 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  41.04 
 
 		 243 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  46.26 
 
 		 253 aa  162  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  44.4 
 
 		 325 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  43.15 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  43.98 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  40.82 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  42.34 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  42.92 
 
 		 255 aa  152  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  41.3 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  35.06 
 
 		 498 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  41.76 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  37.86 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  46.35 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  38.15 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  46.35 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  33.07 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  46.75 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  25.79 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  28.91 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  21.3 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  25.12 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  29.06 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  22.33 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  25.7 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  20.56 
 
 		 257 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  24.35 
 
 		 257 aa  42.7  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  31.31 
 
 		 255 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2327  hypothetical protein  24.19 
 
 		 249 aa  42.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0207977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>