88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2348 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  557  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  61.54 
 
 
301 aa  334  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  57.97 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  53.5 
 
 
294 aa  278  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  55 
 
 
288 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  56.21 
 
 
317 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  57.73 
 
 
324 aa  268  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  58.28 
 
 
315 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  56.73 
 
 
333 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  57.65 
 
 
320 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  52.43 
 
 
295 aa  262  6e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  57.04 
 
 
307 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  53.61 
 
 
319 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  51.69 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  51.69 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  51.69 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  50.71 
 
 
299 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  54.18 
 
 
399 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  56.6 
 
 
298 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  54.18 
 
 
300 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  54.18 
 
 
336 aa  249  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  54.18 
 
 
300 aa  249  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  53.78 
 
 
399 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  53.78 
 
 
300 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  53.39 
 
 
369 aa  248  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  53.78 
 
 
300 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  53.29 
 
 
319 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  53.39 
 
 
300 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  52.99 
 
 
300 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  49.49 
 
 
304 aa  242  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  59.92 
 
 
312 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  56.61 
 
 
319 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  49.83 
 
 
311 aa  232  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  57.64 
 
 
321 aa  229  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  52.25 
 
 
298 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  46.12 
 
 
299 aa  226  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  42.56 
 
 
246 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  43.48 
 
 
258 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  47.41 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  42.11 
 
 
293 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  47.58 
 
 
253 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  40.3 
 
 
335 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  44.88 
 
 
257 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  45.89 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  43.55 
 
 
325 aa  162  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  44.26 
 
 
325 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  41.94 
 
 
255 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  37.45 
 
 
295 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  40.23 
 
 
364 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  39.84 
 
 
392 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  47.06 
 
 
255 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  42.21 
 
 
239 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  42.21 
 
 
324 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  42.68 
 
 
243 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  48.28 
 
 
305 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  41.42 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  36.78 
 
 
355 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  41.85 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  46.77 
 
 
305 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  39.18 
 
 
250 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  37.39 
 
 
498 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  36.14 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  27.49 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  28.97 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  28.28 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4460  hypothetical protein  25.47 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  27.59 
 
 
270 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  26.58 
 
 
274 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  24.75 
 
 
259 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  23.74 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  24.78 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  25.57 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1153  hypothetical protein  25.27 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  28.3 
 
 
256 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  23.23 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  27.67 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  27.67 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  27.67 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  27.67 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  27.67 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  28.3 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  27.67 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  25.24 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  28.3 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  25.25 
 
 
257 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  29.03 
 
 
254 aa  43.1  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  27.9 
 
 
250 aa  42.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  29.88 
 
 
261 aa  42.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>