More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1713 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  94.07 
 
 
270 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  89.26 
 
 
270 aa  455  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  62.45 
 
 
277 aa  280  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1176  hypothetical protein  41.47 
 
 
285 aa  151  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.463747  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  32.33 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  32.2 
 
 
270 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  31.58 
 
 
298 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  32.21 
 
 
268 aa  122  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  32.61 
 
 
272 aa  122  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  31.82 
 
 
268 aa  122  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  31.09 
 
 
267 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  31.14 
 
 
272 aa  122  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  31.95 
 
 
274 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  30.11 
 
 
260 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  29.67 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  30.04 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  30.04 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  29.15 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  32.84 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  32.82 
 
 
267 aa  113  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  27.66 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  28.46 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  34.3 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  33.61 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  27.24 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  32.37 
 
 
272 aa  109  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  31.3 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  34.47 
 
 
268 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  31.52 
 
 
269 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  31.39 
 
 
267 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  35.06 
 
 
263 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  27.68 
 
 
263 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  31.58 
 
 
266 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  31.09 
 
 
265 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  29.46 
 
 
263 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  31.03 
 
 
268 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  29.05 
 
 
263 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  31.09 
 
 
265 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  32.23 
 
 
264 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1464  hypothetical protein  33.58 
 
 
274 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0625984  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2177  hypothetical protein  29.85 
 
 
274 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00465003  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  35.32 
 
 
263 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  29.2 
 
 
261 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  29.77 
 
 
255 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1051  hypothetical protein  29.29 
 
 
277 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  31.37 
 
 
266 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  31.27 
 
 
268 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  30.96 
 
 
265 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  31.8 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  28.74 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  33.47 
 
 
264 aa  99.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  32.03 
 
 
266 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  32.03 
 
 
266 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  29.66 
 
 
260 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2046  hypothetical protein  28.69 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.391203  normal  0.958911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  28.73 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  33.21 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  31.76 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  31.38 
 
 
268 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1621  permease  31.94 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  28.29 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  29.46 
 
 
268 aa  95.5  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  29.46 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0864  protein of unknown function DUF81  27.49 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  31.01 
 
 
266 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  30.66 
 
 
266 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  29.73 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  27.98 
 
 
264 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  29.71 
 
 
265 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  33.83 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.436865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  30.45 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  27.51 
 
 
274 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  31.78 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1927  hypothetical protein  27.98 
 
 
272 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  92  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  29.34 
 
 
277 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05309  integral membrane transmembrane protein  29.81 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  28.22 
 
 
263 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  30.37 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  30.27 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0263  protein of unknown function DUF81  27.49 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.558551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  31.76 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  31.02 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0578  hypothetical protein  27.16 
 
 
272 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1144  hypothetical protein  32.81 
 
 
266 aa  89.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0322  hypothetical protein  26.97 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0350  hypothetical protein  27.69 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.569442  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  31.73 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  31.01 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  27.98 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1333  hypothetical protein  34.26 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  27.41 
 
 
268 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  29.59 
 
 
275 aa  87  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01459  membrane protein  27.84 
 
 
273 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  29.55 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4460  hypothetical protein  30.68 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  28.72 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  29.74 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>