191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05309 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05309  integral membrane transmembrane protein  100 
 
 		 273 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  33.58 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  34.59 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  31.43 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  31.56 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  35.14 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  32.82 
 
 		 268 aa  108  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  31.66 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  32.68 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  30.12 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  30.59 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  28.09 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  31.3 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  29.96 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  32.43 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  31.64 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  30.82 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  33.07 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  31.92 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  33.07 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  27.06 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  29.69 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  27.06 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  30.57 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  30.16 
 
 		 260 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  28.94 
 
 		 263 aa  88.6  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4342  hypothetical protein  33.85 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  30.86 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  32.81 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  28.28 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  31.01 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  26.58 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  28.33 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  30.2 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  34.85 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  29.92 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  28.63 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  30.08 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  31.1 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  29.92 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0864  protein of unknown function DUF81  27.43 
 
 		 272 aa  85.5  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  33.98 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  31.09 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  29.18 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  31.11 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  27.2 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  33.98 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  33.98 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1144  hypothetical protein  34.66 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  30.37 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  33.46 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  31.4 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  32.81 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  29.79 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  30.11 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  28.28 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  28.98 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  27.59 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  28.03 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  28.4 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1333  hypothetical protein  36.51 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  29.75 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  28.3 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  27.73 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  29.65 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  33.46 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  31.73 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  32.4 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  33.46 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  29.63 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  29.55 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  31.7 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  29.08 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  31.3 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  28.12 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  29.67 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  28.77 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  27.48 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  31.91 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000468231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  26.72 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  30.43 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  29.17 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  27.53 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  25.87 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  27.04 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1153  hypothetical protein  27.35 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  31.51 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  29.63 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  28.64 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  30.77 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  26.5 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2046  hypothetical protein  29.06 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.391203  normal  0.958911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4460  hypothetical protein  28.12 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  35.04 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  27.92 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  27.91 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02210  hypothetical protein  27.23 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  27.53 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>