225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02496 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  519  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  70.85 
 
 		 272 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  73.26 
 
 		 274 aa  349  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  62.87 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.436865 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0864  protein of unknown function DUF81  51.68 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  40 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  44.26 
 
 		 276 aa  184  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  42.67 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  43.16 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  41.39 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  39.37 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  40.93 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1927  hypothetical protein  41.25 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  39.84 
 
 		 277 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  38.67 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  46.48 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0578  hypothetical protein  40.86 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  38.62 
 
 		 277 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  41.74 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1051  hypothetical protein  39.32 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  34.94 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  41.74 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0322  hypothetical protein  40.55 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  38.65 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  38 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2177  hypothetical protein  38.15 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00465003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  38.8 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  38.4 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  38.4 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2046  hypothetical protein  45.45 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.391203  normal  0.958911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  38 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  38.25 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  38.4 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  38.5 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  37.6 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  36.25 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  39.47 
 
 		 298 aa  142  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  34.8 
 
 		 268 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  37.13 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  40.38 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  39.24 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  40 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  37.65 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01459  membrane protein  35.06 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  38.18 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  37.02 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  37.4 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  37.74 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  38.59 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  36.32 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  36.11 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  35.9 
 
 		 272 aa  135  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  37.89 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4342  hypothetical protein  38.26 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  40.65 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  36.17 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  38.63 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  37.99 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  38.89 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  36.75 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  37.39 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0366  hypothetical protein  41.35 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  34.35 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  39.6 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  36.96 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  37.31 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1245  hypothetical protein  39.48 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  31.73 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  36.54 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  36.17 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  37.8 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  37.35 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  42.31 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  33.71 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  38.36 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  36.76 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  36.76 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  37.22 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  36.61 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  36.36 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  36.89 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  39.19 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  36.52 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  39.66 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  32.05 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  35.97 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  35.97 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  36.78 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  32.81 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  37.71 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  38.43 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  35.06 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  36.76 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  33.72 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  32.67 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2670  hypothetical protein  35.29 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  35.08 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  36.36 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  33.97 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  38.49 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>