233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1040 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  65.91 
 
 		 264 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  63.98 
 
 		 266 aa  288  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1134  hypothetical protein  64.48 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  64.34 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  64.34 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  64.34 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  63.93 
 
 		 266 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  60.39 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  63.52 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  60.15 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  63.93 
 
 		 266 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  63.52 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  56.56 
 
 		 266 aa  258  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1333  hypothetical protein  61.32 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1144  hypothetical protein  58.17 
 
 		 266 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  46.74 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  44.21 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  40.89 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  41.63 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  40.46 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  39.77 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  41.74 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  44.13 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  46.37 
 
 		 263 aa  176  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  41.27 
 
 		 267 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1153  hypothetical protein  45.18 
 
 		 269 aa  174  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  40.87 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  41.25 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  43.75 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  44.71 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  38.75 
 
 		 264 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  38.75 
 
 		 268 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  44.86 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  45.8 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1245  hypothetical protein  43.18 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  42.35 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  44.07 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  44.06 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  41.38 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  40.08 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  43.43 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  39.6 
 
 		 260 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  39.2 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  39.6 
 
 		 260 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  44.75 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4460  hypothetical protein  43.87 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  40 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  39.6 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  40.43 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  42.75 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  43.48 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  40.47 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  39.66 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  39.47 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  41.11 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  38.63 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  43.51 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  39.29 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  37.55 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  40.82 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  39.69 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  35.97 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  35.97 
 
 		 268 aa  155  9e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  44.14 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  36.36 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4342  hypothetical protein  41.11 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  37.12 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  38.33 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  40.56 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  39.82 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  38.94 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1621  permease  39.84 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  44.17 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  37.45 
 
 		 272 aa  148  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  37.99 
 
 		 271 aa  148  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  35.77 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  38.86 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  36.89 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  36.58 
 
 		 298 aa  143  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  38.43 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  39.11 
 
 		 272 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  35.94 
 
 		 273 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  40.91 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  40.08 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000468231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  38.54 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  37.7 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  39.52 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  34.1 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  35.41 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  33.84 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02210  hypothetical protein  36.36 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  38.57 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2670  hypothetical protein  37 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  31.58 
 
 		 274 aa  125  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  32.05 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  34.54 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  32.71 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  34.2 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.436865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>