250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0650 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  520  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  64.75 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  63.83 
 
 		 271 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  65.38 
 
 		 272 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  64.53 
 
 		 282 aa  288  6e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2670  hypothetical protein  64.89 
 
 		 270 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  62.98 
 
 		 266 aa  278  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  56.07 
 
 		 272 aa  278  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  63.29 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  53.14 
 
 		 272 aa  264  8.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  53.7 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  48.52 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  58.82 
 
 		 272 aa  244  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  52.81 
 
 		 265 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  54.12 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  48.82 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  53.25 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  53.19 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  52.76 
 
 		 268 aa  228  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  53.41 
 
 		 269 aa  228  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  50.56 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  51.07 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  52.76 
 
 		 263 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  50 
 
 		 265 aa  222  6e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  50.65 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  50.61 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  49.21 
 
 		 268 aa  211  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  46.59 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  46.59 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  47.84 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  49.2 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  45.67 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  48.36 
 
 		 268 aa  208  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  45.78 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  53.52 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  48.95 
 
 		 263 aa  206  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4342  hypothetical protein  55.26 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  47.84 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  47.47 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  45.78 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  44.88 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  46.9 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  44.17 
 
 		 264 aa  198  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  44.17 
 
 		 268 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  41.47 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  44.67 
 
 		 265 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  53.74 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  39.92 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  42.86 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1245  hypothetical protein  47.06 
 
 		 266 aa  185  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  44.59 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  40.53 
 
 		 268 aa  182  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  46.83 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000468231  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  45.73 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  50 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  50 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  43.4 
 
 		 263 aa  178  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  38.58 
 
 		 298 aa  178  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  44.71 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  44.35 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  38.72 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  37.97 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  40 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  39.39 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  45.53 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  42.86 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  42.91 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  42.86 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  40.87 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  42.63 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  41.98 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  41.98 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  43.5 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  42.59 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  42.45 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  41.98 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  41.63 
 
 		 269 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1134  hypothetical protein  43.55 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  37.5 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  40.74 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  42.92 
 
 		 260 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1144  hypothetical protein  41.98 
 
 		 266 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  38.63 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1333  hypothetical protein  42.39 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  40.72 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  36.86 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1051  hypothetical protein  38.52 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  37.55 
 
 		 265 aa  138  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2177  hypothetical protein  38.2 
 
 		 274 aa  138  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00465003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  33.07 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  35.74 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  40.37 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  33.05 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  34.47 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  34.51 
 
 		 275 aa  132  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1153  hypothetical protein  40.18 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  38.14 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0611  hypothetical protein  36.5 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  39.84 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>