244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2053 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  73.26 
 
 		 272 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  66.05 
 
 		 272 aa  325  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  58.37 
 
 		 272 aa  262  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.436865 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0864  protein of unknown function DUF81  52.61 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  48.87 
 
 		 276 aa  192  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  43.97 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  40.68 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  41.83 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  42.86 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  41.67 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2046  hypothetical protein  47.24 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.391203  normal  0.958911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  47.13 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  39.47 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  42.45 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  43.46 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  37.94 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  39.2 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1051  hypothetical protein  39.75 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1927  hypothetical protein  40.7 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  38.4 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2177  hypothetical protein  38.78 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00465003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  39.85 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  39.69 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  38.25 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0578  hypothetical protein  40.31 
 
 		 272 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  38.7 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  39.64 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0322  hypothetical protein  39.37 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  40.85 
 
 		 265 aa  148  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  40.85 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  35.86 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  39.41 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  38.08 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  37.05 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  37.3 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  37.05 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  37.05 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  35.32 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  37.05 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  37.05 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  38.1 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01459  membrane protein  36.13 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  38.14 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  38.1 
 
 		 261 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  37.89 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4342  hypothetical protein  41.79 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  38.89 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  35.86 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  34.02 
 
 		 268 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  37.18 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  36.32 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  34.02 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  37.45 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  36.1 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  37.39 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  34.88 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  35.17 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  38.46 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  38.06 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  34.84 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  36.55 
 
 		 241 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  37.05 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  35.54 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  38.33 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  38.33 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  36.64 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4249  hypothetical protein  38.76 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  35.34 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  37.92 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  33.6 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  37.14 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  36.86 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  37.5 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  37.5 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  36.65 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  37.66 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  30.71 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1245  hypothetical protein  36.97 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  37.66 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0366  hypothetical protein  39.24 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  35.44 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  37.55 
 
 		 268 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  37.3 
 
 		 267 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  36.27 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  31.91 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  39.61 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  36.91 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  38.33 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  37.97 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  37.92 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  33.47 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  34.19 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  31.76 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  33.91 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  35.8 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  33.94 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  33.05 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  31.84 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>