More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1708 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
291 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  60.67 
 
 
303 aa  247  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  63.01 
 
 
299 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  57.61 
 
 
291 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  57.4 
 
 
291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  57.4 
 
 
291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  57.55 
 
 
291 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  57.55 
 
 
291 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  58.48 
 
 
291 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  64.56 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  60.67 
 
 
255 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  58.67 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  58.04 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  46.53 
 
 
254 aa  168  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  64.1 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  53.28 
 
 
301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  50.56 
 
 
292 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  44.69 
 
 
254 aa  155  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  37.16 
 
 
265 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  41.08 
 
 
282 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  37.71 
 
 
268 aa  142  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  45.98 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  34.32 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  39.13 
 
 
266 aa  139  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  35.06 
 
 
277 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  37.96 
 
 
250 aa  136  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  35.9 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  34.89 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  41.59 
 
 
252 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  37.87 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  40.89 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  38.82 
 
 
265 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  31.99 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  42.04 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  38.27 
 
 
271 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  32.05 
 
 
261 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  35.2 
 
 
277 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  38.78 
 
 
275 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
267 aa  102  7e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  41.26 
 
 
267 aa  102  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  39.13 
 
 
257 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  37.99 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  37.99 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  37.99 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  38.02 
 
 
275 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  46.26 
 
 
261 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  42.6 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  35.74 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  34.13 
 
 
290 aa  92.8  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  36.24 
 
 
256 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  37.04 
 
 
267 aa  89.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  40.26 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  43.72 
 
 
259 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  32.42 
 
 
293 aa  87  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  39.61 
 
 
250 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  27.57 
 
 
270 aa  85.9  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  30.54 
 
 
276 aa  85.5  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  35.04 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  26.86 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  26.75 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  38.43 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  35.06 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  38.76 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  35.29 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  34.8 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  39.5 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  27.82 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  34.05 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  46.67 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  33.2 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  34.36 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0350  hypothetical protein  32.02 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.569442  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  36.18 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  29.92 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  30.77 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  32.02 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  33.06 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  32.61 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  37.82 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  37.44 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  32.43 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  30.36 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  26.22 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  34.75 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  30.89 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  37.01 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  30.9 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  31.43 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21290  predicted permease  39.69 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0210962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  36.02 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  39.02 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  32.39 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  32.59 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  32.59 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05309  integral membrane transmembrane protein  36.12 
 
 
273 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  34.18 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  28.68 
 
 
260 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  32.68 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>