More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0263 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0263  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
277 aa  533  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.558551 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1464  hypothetical protein  44.65 
 
 
274 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0625984  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0350  hypothetical protein  36.7 
 
 
268 aa  122  6e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.569442  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  36.47 
 
 
294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  35.62 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  36.97 
 
 
269 aa  119  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  32.06 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  33.21 
 
 
270 aa  116  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  35.57 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  35.59 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  35.62 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  30.86 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  34.87 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  31.27 
 
 
268 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  30.9 
 
 
272 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  32.63 
 
 
260 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  32.63 
 
 
260 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  29.82 
 
 
272 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  31.23 
 
 
265 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  31.91 
 
 
276 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  32.27 
 
 
265 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  29.56 
 
 
270 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  32.37 
 
 
264 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  29.15 
 
 
270 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  32.37 
 
 
268 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  33.9 
 
 
263 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  30.4 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  32.77 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  31.54 
 
 
270 aa  99.4  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  26.56 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  30.49 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  35.68 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  35.27 
 
 
268 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  31.86 
 
 
277 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  33.8 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  31.36 
 
 
260 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
261 aa  95.5  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  31.84 
 
 
271 aa  95.5  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  30.82 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  31 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  31.42 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  31.49 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  31.2 
 
 
268 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  33.05 
 
 
268 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  32.88 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  31.36 
 
 
260 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  31.2 
 
 
264 aa  93.6  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  32.22 
 
 
265 aa  92.8  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  34.33 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  29.83 
 
 
268 aa  92  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  28.76 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  31.17 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  30.88 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  33.63 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  32.53 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  29.92 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  33.87 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  31.03 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  30.04 
 
 
264 aa  89  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  29.91 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  36.06 
 
 
278 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  30.77 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  32.74 
 
 
269 aa  86.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  26.4 
 
 
277 aa  85.5  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  29.11 
 
 
255 aa  85.5  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  31.54 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  31.22 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  30.68 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  35.15 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  30.38 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  31.6 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0366  hypothetical protein  30.28 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2046  hypothetical protein  30.47 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.391203  normal  0.958911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1051  hypothetical protein  27.9 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2177  hypothetical protein  29.05 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00465003  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  31.49 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.92 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2670  hypothetical protein  28.63 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4342  hypothetical protein  31.78 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  31.62 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  31.15 
 
 
255 aa  79  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  28.85 
 
 
268 aa  79  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0864  protein of unknown function DUF81  27.57 
 
 
272 aa  79  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  27.35 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  30.51 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  30.77 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  29.36 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  26.92 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  29.58 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  30.74 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  32.86 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  28.21 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  23.62 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  31.1 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  27.62 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  27.62 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  32.85 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  32.54 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>