88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4044 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  98.33 
 
 		 300 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  86.56 
 
 		 305 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  60.07 
 
 		 324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  59.92 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  58.27 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  65.22 
 
 		 239 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  55.27 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  55.65 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  47.08 
 
 		 392 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  47.17 
 
 		 295 aa  228  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  47 
 
 		 335 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  43.73 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  51.27 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  45.74 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  49.8 
 
 		 258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  50.2 
 
 		 364 aa  210  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  46.58 
 
 		 498 aa  206  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  50.86 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  47.41 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  46.31 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  50.43 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  46.31 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  46.31 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  46.31 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  44.88 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  45.28 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  46.31 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  45.9 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  45.9 
 
 		 399 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  45.49 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  48.71 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  47.88 
 
 		 288 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  46.35 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  47.58 
 
 		 253 aa  195  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  45.34 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  47.86 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  44.54 
 
 		 250 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  46.22 
 
 		 257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  45.08 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  42.48 
 
 		 338 aa  179  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  51.5 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  49.57 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  53.02 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  48.28 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  49.37 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  46.29 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  45.93 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  43.58 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  43.58 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  43.58 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  47.88 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  50.81 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  43.48 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  50 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  45.87 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  47.58 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  50 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  48.51 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  49.36 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  50 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  49.56 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  35.26 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  25.93 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  25.55 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  25.93 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  25.93 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  25.93 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  25.93 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  26.74 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  26.98 
 
 		 254 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  25.44 
 
 		 256 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  27.93 
 
 		 268 aa  46.6  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  36.09 
 
 		 307 aa  46.2  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  25.67 
 
 		 274 aa  45.8  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  25 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  26.7 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0060  hypothetical protein  29.26 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  25.66 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  26.17 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  28.69 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  25.66 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  26.4 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2277  protein of unknown function DUF81  30.51 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  25.4 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  26.9 
 
 		 263 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  26.21 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  24.85 
 
 		 257 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>