87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4087 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  58.8 
 
 		 255 aa  282  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  60.73 
 
 		 255 aa  273  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  55.04 
 
 		 243 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  53.42 
 
 		 243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  51.44 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  51.64 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  49.17 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  46.44 
 
 		 293 aa  204  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  49.8 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  48.13 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  51.27 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  50.21 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  48.39 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  48.13 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  44.22 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  40.4 
 
 		 392 aa  191  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  43.08 
 
 		 336 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  42.69 
 
 		 369 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  43.15 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  43.15 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  45.2 
 
 		 288 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  43.15 
 
 		 300 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  42.74 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  42.86 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  43.27 
 
 		 355 aa  185  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  42.74 
 
 		 300 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  42.74 
 
 		 300 aa  185  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  42.74 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  42.74 
 
 		 399 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  51.27 
 
 		 305 aa  175  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  40.95 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  40.95 
 
 		 338 aa  168  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  43.78 
 
 		 312 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  43.85 
 
 		 303 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  42.8 
 
 		 364 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  42.04 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  46.31 
 
 		 320 aa  165  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  51.67 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  41.91 
 
 		 299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  47.5 
 
 		 312 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  46.99 
 
 		 304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  47.5 
 
 		 312 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  47.5 
 
 		 312 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  46.31 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  47.41 
 
 		 311 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  42.34 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  38.93 
 
 		 498 aa  155  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  44.1 
 
 		 295 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  44.26 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  44.17 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  43.93 
 
 		 333 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  45.31 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  46.12 
 
 		 298 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  46.86 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  43.57 
 
 		 319 aa  141  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  45.89 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  43.04 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  38.17 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  45.42 
 
 		 319 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  41.7 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  41.8 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  28.65 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  28.65 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  28.65 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  28.65 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  28.65 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  28.65 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  28.65 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  28.65 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  28.65 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  29.7 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  24.77 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  25.84 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  27.17 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  27.17 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  30.95 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  27.67 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  25.12 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  26.15 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  32 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  23.03 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  23.97 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  23.97 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  30.89 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  30.7 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  23.78 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>