83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3380 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  596  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  87.23 
 
 
321 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  57.49 
 
 
301 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  64.79 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  62.24 
 
 
307 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  59.09 
 
 
317 aa  301  8.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  60.9 
 
 
315 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  57.83 
 
 
319 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  61.37 
 
 
333 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  56.33 
 
 
312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  56.33 
 
 
312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  56.33 
 
 
312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  50.33 
 
 
399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  59.06 
 
 
303 aa  281  9e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  57.86 
 
 
319 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  50.33 
 
 
336 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  50.33 
 
 
300 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  50 
 
 
399 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  50.33 
 
 
300 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  49.33 
 
 
300 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  50 
 
 
300 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  49.34 
 
 
369 aa  279  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  53.41 
 
 
299 aa  278  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  59.73 
 
 
312 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  49.67 
 
 
300 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  51.21 
 
 
300 aa  275  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  57.04 
 
 
293 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  48.64 
 
 
294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  53.31 
 
 
295 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  50.7 
 
 
288 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  55.32 
 
 
304 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  55.17 
 
 
311 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  57.53 
 
 
319 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  58.51 
 
 
298 aa  252  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  55.15 
 
 
298 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  44.62 
 
 
299 aa  223  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  46.31 
 
 
262 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  38.96 
 
 
246 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  42.23 
 
 
255 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  42.42 
 
 
335 aa  165  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  40.82 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  49.15 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  42.4 
 
 
258 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  43.21 
 
 
250 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  43.72 
 
 
325 aa  160  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  37.96 
 
 
392 aa  155  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  35.97 
 
 
355 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  41.81 
 
 
312 aa  149  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  43.21 
 
 
325 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  37.92 
 
 
295 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  43.1 
 
 
324 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  45.05 
 
 
253 aa  148  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  40.32 
 
 
243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  42.68 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  40.16 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  42.8 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  41.2 
 
 
255 aa  146  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  37.45 
 
 
364 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  50.21 
 
 
305 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  50.87 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  33.74 
 
 
498 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  32.4 
 
 
338 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  25.75 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  25.75 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  25.75 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  25.75 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  29.95 
 
 
265 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  25.75 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  27.67 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  26.35 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  25.75 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  26.95 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  26.35 
 
 
256 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  25.15 
 
 
256 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  25.75 
 
 
256 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  24.44 
 
 
266 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1631  protein of unknown function DUF81  24.24 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000001538  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  27.27 
 
 
259 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0060  hypothetical protein  28.57 
 
 
250 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  25.59 
 
 
274 aa  43.1  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2327  hypothetical protein  27.47 
 
 
249 aa  42.7  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0207977  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  33.33 
 
 
315 aa  42.4  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>