86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3716 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
253 aa  485  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  47.93 
 
 
293 aa  226  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  45.42 
 
 
392 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  46.84 
 
 
246 aa  222  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  48.56 
 
 
243 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  48.97 
 
 
243 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  49.8 
 
 
262 aa  215  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  48.13 
 
 
325 aa  208  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  45.53 
 
 
295 aa  208  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  44.09 
 
 
335 aa  205  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  47.37 
 
 
325 aa  203  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  47.72 
 
 
324 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  44.31 
 
 
258 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  46.89 
 
 
255 aa  202  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  40.16 
 
 
355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  47.68 
 
 
399 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  47.68 
 
 
399 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  47.68 
 
 
300 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  47.84 
 
 
239 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  47.68 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  47.68 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  46.84 
 
 
369 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  47.26 
 
 
336 aa  195  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  47.66 
 
 
255 aa  194  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  46.41 
 
 
300 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  46.41 
 
 
300 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  46.41 
 
 
300 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  44.21 
 
 
312 aa  193  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  46.84 
 
 
299 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  45.53 
 
 
300 aa  188  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  46.69 
 
 
257 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  43.62 
 
 
364 aa  186  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  43.6 
 
 
288 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  41.7 
 
 
294 aa  184  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  38.71 
 
 
498 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  43.7 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  47.01 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  42.8 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  46.15 
 
 
305 aa  168  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  47.76 
 
 
305 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  37.61 
 
 
338 aa  161  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  45.22 
 
 
303 aa  159  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  45.26 
 
 
295 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  44.84 
 
 
312 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  44.84 
 
 
312 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  44.84 
 
 
312 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  45.68 
 
 
311 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  44.63 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  47.06 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  44.78 
 
 
324 aa  142  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  44.39 
 
 
319 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  44.54 
 
 
320 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  42.74 
 
 
317 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  44.68 
 
 
307 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  42.74 
 
 
298 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  41.45 
 
 
315 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  41.28 
 
 
333 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  39.38 
 
 
312 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  39.57 
 
 
319 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  43.1 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  43.89 
 
 
319 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  41.22 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  31.76 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  31.08 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  31.08 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  31.08 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  31.08 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  31.08 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  31.08 
 
 
256 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  31.76 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  31.76 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  29.67 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  30 
 
 
256 aa  52.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  28.41 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  28.41 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  25.26 
 
 
255 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  29.05 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  32.18 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  31.63 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1631  protein of unknown function DUF81  24.79 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000001538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  21.43 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  27.91 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  25.71 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  23.14 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0060  hypothetical protein  26.63 
 
 
250 aa  42.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  27.59 
 
 
261 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>