63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0200 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  100 
 
 		 364 aa  717    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  51.19 
 
 		 335 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  55.34 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  53.15 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  48.29 
 
 		 295 aa  257  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  53.28 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  42.22 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  40.06 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  41.64 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  43.79 
 
 		 312 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  52.19 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  41.59 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  51.45 
 
 		 239 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  41.55 
 
 		 498 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  51.01 
 
 		 300 aa  209  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  41.84 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  42.2 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  42.7 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  43.45 
 
 		 336 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  43.83 
 
 		 253 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  43.94 
 
 		 300 aa  193  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  43.94 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  44.32 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  43.94 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  43.18 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  43.94 
 
 		 300 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  43.56 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  42.91 
 
 		 294 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  42.8 
 
 		 262 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  50.2 
 
 		 305 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  43.51 
 
 		 255 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  40.86 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  41.37 
 
 		 243 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  41.31 
 
 		 243 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  39.92 
 
 		 258 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  39.08 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  41.13 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  39.84 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  51.64 
 
 		 305 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  40.47 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  42.34 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  43.49 
 
 		 304 aa  159  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  39.53 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  44.15 
 
 		 311 aa  155  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  40.37 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  40.37 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  40.37 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  37.45 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  43.08 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  40.23 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  41.11 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  34.66 
 
 		 295 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  40.46 
 
 		 307 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  36.9 
 
 		 321 aa  133  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  39.6 
 
 		 333 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  38.74 
 
 		 317 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  39.68 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  38.37 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  38.49 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  39.31 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  38.08 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  35.56 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0060  hypothetical protein  25.12 
 
 		 250 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>